Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
CNBD1Q8NA66 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
CNBD1Q8NA66 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CNBD1Q8NA66 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CNBD1Q8NA66 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CNBD1Q8NA66 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CNBD1Q8NA66 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CNBD1Q8NA66 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CNBD1Q8NA66 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CNBD1Q8NA66 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CNBD1Q8NA66 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CNBD1Q8NA66 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CNBD1Q8NA66 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CNBD1Q8NA66 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CNBD1Q8NA66 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CNBD1Q8NA66 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CNBD1Q8NA66 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CNBD1Q8NA66 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CNBD1Q8NA66 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CNBD1Q8NA66 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CNBD1Q8NA66 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CNBD1Q8NA66 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CNBD1Q8NA66 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CNBD1Q8NA66 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CNBD1Q8NA66 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CNBD1Q8NA66 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CNBD1Q8NA66 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CNBD1Q8NA66 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
CNBD1Q8NA66 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CNBD1Q8NA66 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CNBD1Q8NA66 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CNBD1Q8NA66 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CNBD1Q8NA66 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CNBD1Q8NA66 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CNBD1Q8NA66 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CNBD1Q8NA66 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CNBD1Q8NA66 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CNBD1Q8NA66 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CNBD1Q8NA66 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CNBD1Q8NA66 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CNBD1Q8NA66 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CNBD1Q8NA66 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CNBD1Q8NA66 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CNBD1Q8NA66 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CNBD1Q8NA66 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CNBD1Q8NA66 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CNBD1Q8NA66 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CNBD1Q8NA66 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CNBD1Q8NA66 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CNBD1Q8NA66 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CNBD1Q8NA66 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.89
CNBD1Q8NA66 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CNBD1Q8NA66 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CNBD1Q8NA66 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CNBD1Q8NA66 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CNBD1Q8NA66 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CNBD1Q8NA66 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CNBD1Q8NA66 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CNBD1Q8NA66 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CNBD1Q8NA66 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CNBD1Q8NA66 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CNBD1Q8NA66 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CNBD1Q8NA66 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CNBD1Q8NA66 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CNBD1Q8NA66 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CNBD1Q8NA66 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CNBD1Q8NA66 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CNBD1Q8NA66 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CNBD1Q8NA66 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CNBD1Q8NA66 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CNBD1Q8NA66 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CNBD1Q8NA66 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CNBD1Q8NA66 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CNBD1Q8NA66 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CNBD1Q8NA66 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CNBD1Q8NA66 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CNBD1Q8NA66 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CNBD1Q8NA66 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CNBD1Q8NA66 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CNBD1Q8NA66 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CNBD1Q8NA66 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CNBD1Q8NA66 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CNBD1Q8NA66 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CNBD1Q8NA66 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CNBD1Q8NA66 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CNBD1Q8NA66 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CNBD1Q8NA66 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CNBD1Q8NA66 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CNBD1Q8NA66 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CNBD1Q8NA66 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CNBD1Q8NA66 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CNBD1Q8NA66 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CNBD1Q8NA66 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CNBD1Q8NA66 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CNBD1Q8NA66 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CNBD1Q8NA66 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CNBD1Q8NA66 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CNBD1Q8NA66 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CNBD1Q8NA66 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CNBD1Q8NA66 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms