Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNAAF3Q8N9W5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNAAF3Q8N9W5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNAAF3Q8N9W5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNAAF3Q8N9W5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNAAF3Q8N9W5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DNAAF3Q8N9W5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DNAAF3Q8N9W5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DNAAF3Q8N9W5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DNAAF3Q8N9W5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DNAAF3Q8N9W5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DNAAF3Q8N9W5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DNAAF3Q8N9W5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DNAAF3Q8N9W5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DNAAF3Q8N9W5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DNAAF3Q8N9W5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DNAAF3Q8N9W5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DNAAF3Q8N9W5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DNAAF3Q8N9W5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DNAAF3Q8N9W5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DNAAF3Q8N9W5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
DNAAF3Q8N9W5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DNAAF3Q8N9W5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DNAAF3Q8N9W5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DNAAF3Q8N9W5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNAAF3Q8N9W5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNAAF3Q8N9W5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNAAF3Q8N9W5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNAAF3Q8N9W5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DNAAF3Q8N9W5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DNAAF3Q8N9W5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DNAAF3Q8N9W5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNAAF3Q8N9W5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNAAF3Q8N9W5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNAAF3Q8N9W5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNAAF3Q8N9W5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNAAF3Q8N9W5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNAAF3Q8N9W5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNAAF3Q8N9W5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNAAF3Q8N9W5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNAAF3Q8N9W5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNAAF3Q8N9W5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNAAF3Q8N9W5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DNAAF3Q8N9W5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DNAAF3Q8N9W5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
DNAAF3Q8N9W5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DNAAF3Q8N9W5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DNAAF3Q8N9W5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DNAAF3Q8N9W5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DNAAF3Q8N9W5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DNAAF3Q8N9W5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DNAAF3Q8N9W5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DNAAF3Q8N9W5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DNAAF3Q8N9W5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAAF3Q8N9W5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAAF3Q8N9W5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNAAF3Q8N9W5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DNAAF3Q8N9W5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DNAAF3Q8N9W5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DNAAF3Q8N9W5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNAAF3Q8N9W5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DNAAF3Q8N9W5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNAAF3Q8N9W5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNAAF3Q8N9W5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNAAF3Q8N9W5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAAF3Q8N9W5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAAF3Q8N9W5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAAF3Q8N9W5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNAAF3Q8N9W5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNAAF3Q8N9W5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNAAF3Q8N9W5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNAAF3Q8N9W5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
DNAAF3Q8N9W5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNAAF3Q8N9W5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNAAF3Q8N9W5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNAAF3Q8N9W5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAAF3Q8N9W5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAAF3Q8N9W5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAAF3Q8N9W5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAAF3Q8N9W5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAAF3Q8N9W5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DNAAF3Q8N9W5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNAAF3Q8N9W5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNAAF3Q8N9W5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNAAF3Q8N9W5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNAAF3Q8N9W5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNAAF3Q8N9W5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAAF3Q8N9W5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNAAF3Q8N9W5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNAAF3Q8N9W5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DNAAF3Q8N9W5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DNAAF3Q8N9W5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DNAAF3Q8N9W5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DNAAF3Q8N9W5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DNAAF3Q8N9W5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DNAAF3Q8N9W5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DNAAF3Q8N9W5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DNAAF3Q8N9W5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DNAAF3Q8N9W5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DNAAF3Q8N9W5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms