Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYT2Q8N9I0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYT2Q8N9I0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYT2Q8N9I0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYT2Q8N9I0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYT2Q8N9I0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYT2Q8N9I0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYT2Q8N9I0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYT2Q8N9I0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYT2Q8N9I0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYT2Q8N9I0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYT2Q8N9I0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYT2Q8N9I0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYT2Q8N9I0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYT2Q8N9I0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYT2Q8N9I0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYT2Q8N9I0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYT2Q8N9I0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SYT2Q8N9I0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYT2Q8N9I0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYT2Q8N9I0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYT2Q8N9I0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYT2Q8N9I0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYT2Q8N9I0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYT2Q8N9I0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYT2Q8N9I0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYT2Q8N9I0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYT2Q8N9I0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYT2Q8N9I0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYT2Q8N9I0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYT2Q8N9I0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYT2Q8N9I0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYT2Q8N9I0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYT2Q8N9I0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYT2Q8N9I0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYT2Q8N9I0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYT2Q8N9I0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYT2Q8N9I0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYT2Q8N9I0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SYT2Q8N9I0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYT2Q8N9I0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYT2Q8N9I0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYT2Q8N9I0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYT2Q8N9I0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYT2Q8N9I0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYT2Q8N9I0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYT2Q8N9I0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYT2Q8N9I0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SYT2Q8N9I0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYT2Q8N9I0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYT2Q8N9I0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYT2Q8N9I0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYT2Q8N9I0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYT2Q8N9I0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYT2Q8N9I0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SYT2Q8N9I0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYT2Q8N9I0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYT2Q8N9I0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYT2Q8N9I0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYT2Q8N9I0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYT2Q8N9I0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SYT2Q8N9I0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYT2Q8N9I0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SYT2Q8N9I0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYT2Q8N9I0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYT2Q8N9I0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYT2Q8N9I0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYT2Q8N9I0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYT2Q8N9I0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYT2Q8N9I0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYT2Q8N9I0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYT2Q8N9I0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYT2Q8N9I0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYT2Q8N9I0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYT2Q8N9I0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYT2Q8N9I0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYT2Q8N9I0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYT2Q8N9I0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYT2Q8N9I0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYT2Q8N9I0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYT2Q8N9I0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYT2Q8N9I0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYT2Q8N9I0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYT2Q8N9I0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYT2Q8N9I0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYT2Q8N9I0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYT2Q8N9I0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYT2Q8N9I0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SYT2Q8N9I0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SYT2Q8N9I0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYT2Q8N9I0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYT2Q8N9I0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYT2Q8N9I0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYT2Q8N9I0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYT2Q8N9I0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYT2Q8N9I0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYT2Q8N9I0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYT2Q8N9I0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYT2Q8N9I0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYT2Q8N9I0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms