Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7B6

PACRGL, PACRG-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACRGLQ8N7B6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PACRGLQ8N7B6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PACRGLQ8N7B6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PACRGLQ8N7B6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PACRGLQ8N7B6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PACRGLQ8N7B6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PACRGLQ8N7B6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PACRGLQ8N7B6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PACRGLQ8N7B6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PACRGLQ8N7B6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PACRGLQ8N7B6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PACRGLQ8N7B6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PACRGLQ8N7B6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PACRGLQ8N7B6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PACRGLQ8N7B6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PACRGLQ8N7B6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PACRGLQ8N7B6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PACRGLQ8N7B6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PACRGLQ8N7B6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PACRGLQ8N7B6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PACRGLQ8N7B6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PACRGLQ8N7B6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PACRGLQ8N7B6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PACRGLQ8N7B6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PACRGLQ8N7B6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PACRGLQ8N7B6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PACRGLQ8N7B6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PACRGLQ8N7B6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PACRGLQ8N7B6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PACRGLQ8N7B6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PACRGLQ8N7B6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PACRGLQ8N7B6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PACRGLQ8N7B6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PACRGLQ8N7B6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PACRGLQ8N7B6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PACRGLQ8N7B6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PACRGLQ8N7B6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PACRGLQ8N7B6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PACRGLQ8N7B6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PACRGLQ8N7B6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PACRGLQ8N7B6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PACRGLQ8N7B6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PACRGLQ8N7B6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PACRGLQ8N7B6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACRGLQ8N7B6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PACRGLQ8N7B6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PACRGLQ8N7B6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PACRGLQ8N7B6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PACRGLQ8N7B6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PACRGLQ8N7B6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PACRGLQ8N7B6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PACRGLQ8N7B6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PACRGLQ8N7B6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PACRGLQ8N7B6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PACRGLQ8N7B6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PACRGLQ8N7B6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PACRGLQ8N7B6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PACRGLQ8N7B6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PACRGLQ8N7B6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PACRGLQ8N7B6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PACRGLQ8N7B6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PACRGLQ8N7B6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PACRGLQ8N7B6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PACRGLQ8N7B6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PACRGLQ8N7B6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PACRGLQ8N7B6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PACRGLQ8N7B6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PACRGLQ8N7B6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PACRGLQ8N7B6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PACRGLQ8N7B6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PACRGLQ8N7B6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PACRGLQ8N7B6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PACRGLQ8N7B6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PACRGLQ8N7B6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PACRGLQ8N7B6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PACRGLQ8N7B6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PACRGLQ8N7B6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PACRGLQ8N7B6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PACRGLQ8N7B6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PACRGLQ8N7B6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PACRGLQ8N7B6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PACRGLQ8N7B6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PACRGLQ8N7B6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PACRGLQ8N7B6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PACRGLQ8N7B6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PACRGLQ8N7B6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PACRGLQ8N7B6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PACRGLQ8N7B6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PACRGLQ8N7B6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PACRGLQ8N7B6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PACRGLQ8N7B6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PACRGLQ8N7B6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PACRGLQ8N7B6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PACRGLQ8N7B6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PACRGLQ8N7B6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PACRGLQ8N7B6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PACRGLQ8N7B6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PACRGLQ8N7B6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PACRGLQ8N7B6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PACRGLQ8N7B6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms