Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSGALNACT2Q8N6G5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSGALNACT2Q8N6G5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CSGALNACT2Q8N6G5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CSGALNACT2Q8N6G5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CSGALNACT2Q8N6G5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CSGALNACT2Q8N6G5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CSGALNACT2Q8N6G5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CSGALNACT2Q8N6G5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CSGALNACT2Q8N6G5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSGALNACT2Q8N6G5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSGALNACT2Q8N6G5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSGALNACT2Q8N6G5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CSGALNACT2Q8N6G5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CSGALNACT2Q8N6G5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CSGALNACT2Q8N6G5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CSGALNACT2Q8N6G5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSGALNACT2Q8N6G5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSGALNACT2Q8N6G5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CSGALNACT2Q8N6G5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSGALNACT2Q8N6G5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSGALNACT2Q8N6G5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CSGALNACT2Q8N6G5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CSGALNACT2Q8N6G5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CSGALNACT2Q8N6G5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSGALNACT2Q8N6G5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSGALNACT2Q8N6G5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSGALNACT2Q8N6G5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CSGALNACT2Q8N6G5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CSGALNACT2Q8N6G5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CSGALNACT2Q8N6G5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSGALNACT2Q8N6G5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSGALNACT2Q8N6G5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSGALNACT2Q8N6G5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSGALNACT2Q8N6G5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSGALNACT2Q8N6G5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSGALNACT2Q8N6G5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSGALNACT2Q8N6G5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSGALNACT2Q8N6G5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSGALNACT2Q8N6G5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSGALNACT2Q8N6G5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSGALNACT2Q8N6G5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSGALNACT2Q8N6G5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSGALNACT2Q8N6G5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSGALNACT2Q8N6G5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSGALNACT2Q8N6G5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSGALNACT2Q8N6G5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSGALNACT2Q8N6G5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSGALNACT2Q8N6G5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSGALNACT2Q8N6G5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSGALNACT2Q8N6G5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CSGALNACT2Q8N6G5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSGALNACT2Q8N6G5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSGALNACT2Q8N6G5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSGALNACT2Q8N6G5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSGALNACT2Q8N6G5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSGALNACT2Q8N6G5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CSGALNACT2Q8N6G5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSGALNACT2Q8N6G5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CSGALNACT2Q8N6G5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CSGALNACT2Q8N6G5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CSGALNACT2Q8N6G5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CSGALNACT2Q8N6G5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CSGALNACT2Q8N6G5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CSGALNACT2Q8N6G5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CSGALNACT2Q8N6G5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CSGALNACT2Q8N6G5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CSGALNACT2Q8N6G5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CSGALNACT2Q8N6G5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CSGALNACT2Q8N6G5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CSGALNACT2Q8N6G5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CSGALNACT2Q8N6G5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CSGALNACT2Q8N6G5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CSGALNACT2Q8N6G5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CSGALNACT2Q8N6G5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CSGALNACT2Q8N6G5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CSGALNACT2Q8N6G5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CSGALNACT2Q8N6G5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CSGALNACT2Q8N6G5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CSGALNACT2Q8N6G5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CSGALNACT2Q8N6G5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CSGALNACT2Q8N6G5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CSGALNACT2Q8N6G5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CSGALNACT2Q8N6G5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CSGALNACT2Q8N6G5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CSGALNACT2Q8N6G5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSGALNACT2Q8N6G5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSGALNACT2Q8N6G5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSGALNACT2Q8N6G5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSGALNACT2Q8N6G5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSGALNACT2Q8N6G5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSGALNACT2Q8N6G5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms