Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CNTROBQ8N137 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CNTROBQ8N137 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CNTROBQ8N137 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CNTROBQ8N137 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
CNTROBQ8N137 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
CNTROBQ8N137 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CNTROBQ8N137 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CNTROBQ8N137 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CNTROBQ8N137 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CNTROBQ8N137 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
CNTROBQ8N137 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CNTROBQ8N137 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
CNTROBQ8N137 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CNTROBQ8N137 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CNTROBQ8N137 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CNTROBQ8N137 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CNTROBQ8N137 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CNTROBQ8N137 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CNTROBQ8N137 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CNTROBQ8N137 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CNTROBQ8N137 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CNTROBQ8N137 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CNTROBQ8N137 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CNTROBQ8N137 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CNTROBQ8N137 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CNTROBQ8N137 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CNTROBQ8N137 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CNTROBQ8N137 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CNTROBQ8N137 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CNTROBQ8N137 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CNTROBQ8N137 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CNTROBQ8N137 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CNTROBQ8N137 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CNTROBQ8N137 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
CNTROBQ8N137 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
CNTROBQ8N137 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
CNTROBQ8N137 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CNTROBQ8N137 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CNTROBQ8N137 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CNTROBQ8N137 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CNTROBQ8N137 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CNTROBQ8N137 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CNTROBQ8N137 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CNTROBQ8N137 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CNTROBQ8N137 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CNTROBQ8N137 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CNTROBQ8N137 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CNTROBQ8N137 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CNTROBQ8N137 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CNTROBQ8N137 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CNTROBQ8N137 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CNTROBQ8N137 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CNTROBQ8N137 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CNTROBQ8N137 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CNTROBQ8N137 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CNTROBQ8N137 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CNTROBQ8N137 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CNTROBQ8N137 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CNTROBQ8N137 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CNTROBQ8N137 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CNTROBQ8N137 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CNTROBQ8N137 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CNTROBQ8N137 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CNTROBQ8N137 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
CNTROBQ8N137 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CNTROBQ8N137 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
CNTROBQ8N137 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CNTROBQ8N137 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CNTROBQ8N137 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CNTROBQ8N137 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CNTROBQ8N137 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CNTROBQ8N137 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CNTROBQ8N137 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CNTROBQ8N137 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CNTROBQ8N137 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CNTROBQ8N137 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CNTROBQ8N137 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CNTROBQ8N137 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CNTROBQ8N137 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CNTROBQ8N137 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CNTROBQ8N137 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CNTROBQ8N137 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CNTROBQ8N137 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CNTROBQ8N137 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CNTROBQ8N137 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CNTROBQ8N137 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CNTROBQ8N137 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CNTROBQ8N137 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CNTROBQ8N137 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CNTROBQ8N137 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CNTROBQ8N137 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CNTROBQ8N137 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CNTROBQ8N137 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CNTROBQ8N137 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CNTROBQ8N137 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CNTROBQ8N137 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CNTROBQ8N137 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CNTROBQ8N137 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CNTROBQ8N137 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms