Protein–RNA interactions for Protein: Q8N126

CADM3, Cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM3Q8N126 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CADM3Q8N126 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CADM3Q8N126 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CADM3Q8N126 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CADM3Q8N126 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CADM3Q8N126 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CADM3Q8N126 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CADM3Q8N126 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CADM3Q8N126 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CADM3Q8N126 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CADM3Q8N126 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CADM3Q8N126 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CADM3Q8N126 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CADM3Q8N126 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CADM3Q8N126 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CADM3Q8N126 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CADM3Q8N126 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CADM3Q8N126 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CADM3Q8N126 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CADM3Q8N126 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CADM3Q8N126 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CADM3Q8N126 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CADM3Q8N126 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CADM3Q8N126 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CADM3Q8N126 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CADM3Q8N126 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CADM3Q8N126 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CADM3Q8N126 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CADM3Q8N126 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CADM3Q8N126 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CADM3Q8N126 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CADM3Q8N126 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CADM3Q8N126 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CADM3Q8N126 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CADM3Q8N126 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CADM3Q8N126 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CADM3Q8N126 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CADM3Q8N126 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CADM3Q8N126 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CADM3Q8N126 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CADM3Q8N126 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CADM3Q8N126 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CADM3Q8N126 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CADM3Q8N126 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CADM3Q8N126 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CADM3Q8N126 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CADM3Q8N126 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CADM3Q8N126 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CADM3Q8N126 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CADM3Q8N126 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CADM3Q8N126 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CADM3Q8N126 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CADM3Q8N126 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CADM3Q8N126 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CADM3Q8N126 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CADM3Q8N126 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CADM3Q8N126 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CADM3Q8N126 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CADM3Q8N126 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CADM3Q8N126 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CADM3Q8N126 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CADM3Q8N126 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CADM3Q8N126 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CADM3Q8N126 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CADM3Q8N126 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CADM3Q8N126 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CADM3Q8N126 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CADM3Q8N126 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CADM3Q8N126 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CADM3Q8N126 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CADM3Q8N126 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CADM3Q8N126 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CADM3Q8N126 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CADM3Q8N126 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CADM3Q8N126 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CADM3Q8N126 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CADM3Q8N126 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CADM3Q8N126 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CADM3Q8N126 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CADM3Q8N126 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CADM3Q8N126 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CADM3Q8N126 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CADM3Q8N126 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CADM3Q8N126 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CADM3Q8N126 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CADM3Q8N126 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CADM3Q8N126 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CADM3Q8N126 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CADM3Q8N126 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CADM3Q8N126 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CADM3Q8N126 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CADM3Q8N126 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CADM3Q8N126 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CADM3Q8N126 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CADM3Q8N126 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CADM3Q8N126 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CADM3Q8N126 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CADM3Q8N126 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CADM3Q8N126 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CADM3Q8N126 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms