Protein–RNA interactions for Protein: Q8K596

Slc8a2, Sodium/calcium exchanger 2, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a2Q8K596 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc8a2Q8K596 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc8a2Q8K596 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Slc8a2Q8K596 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc8a2Q8K596 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc8a2Q8K596 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc8a2Q8K596 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc8a2Q8K596 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc8a2Q8K596 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc8a2Q8K596 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc8a2Q8K596 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc8a2Q8K596 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc8a2Q8K596 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc8a2Q8K596 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc8a2Q8K596 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc8a2Q8K596 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc8a2Q8K596 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc8a2Q8K596 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc8a2Q8K596 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc8a2Q8K596 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc8a2Q8K596 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc8a2Q8K596 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc8a2Q8K596 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc8a2Q8K596 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc8a2Q8K596 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc8a2Q8K596 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc8a2Q8K596 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc8a2Q8K596 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc8a2Q8K596 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc8a2Q8K596 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc8a2Q8K596 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc8a2Q8K596 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc8a2Q8K596 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc8a2Q8K596 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc8a2Q8K596 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc8a2Q8K596 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc8a2Q8K596 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc8a2Q8K596 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc8a2Q8K596 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc8a2Q8K596 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc8a2Q8K596 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc8a2Q8K596 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc8a2Q8K596 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc8a2Q8K596 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc8a2Q8K596 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc8a2Q8K596 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc8a2Q8K596 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc8a2Q8K596 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc8a2Q8K596 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc8a2Q8K596 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc8a2Q8K596 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc8a2Q8K596 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc8a2Q8K596 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc8a2Q8K596 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc8a2Q8K596 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc8a2Q8K596 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc8a2Q8K596 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc8a2Q8K596 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc8a2Q8K596 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc8a2Q8K596 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc8a2Q8K596 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc8a2Q8K596 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc8a2Q8K596 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc8a2Q8K596 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc8a2Q8K596 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc8a2Q8K596 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc8a2Q8K596 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc8a2Q8K596 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc8a2Q8K596 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc8a2Q8K596 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc8a2Q8K596 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc8a2Q8K596 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc8a2Q8K596 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc8a2Q8K596 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc8a2Q8K596 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc8a2Q8K596 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc8a2Q8K596 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc8a2Q8K596 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc8a2Q8K596 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc8a2Q8K596 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc8a2Q8K596 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc8a2Q8K596 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc8a2Q8K596 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc8a2Q8K596 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc8a2Q8K596 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc8a2Q8K596 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc8a2Q8K596 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc8a2Q8K596 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc8a2Q8K596 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc8a2Q8K596 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc8a2Q8K596 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc8a2Q8K596 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc8a2Q8K596 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc8a2Q8K596 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc8a2Q8K596 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc8a2Q8K596 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc8a2Q8K596 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc8a2Q8K596 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc8a2Q8K596 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc8a2Q8K596 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184.3 ms