Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4L4

Pof1b, Protein POF1B, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pof1bQ8K4L4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pof1bQ8K4L4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pof1bQ8K4L4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pof1bQ8K4L4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pof1bQ8K4L4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pof1bQ8K4L4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pof1bQ8K4L4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pof1bQ8K4L4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pof1bQ8K4L4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pof1bQ8K4L4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pof1bQ8K4L4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pof1bQ8K4L4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pof1bQ8K4L4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pof1bQ8K4L4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pof1bQ8K4L4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pof1bQ8K4L4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Pof1bQ8K4L4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pof1bQ8K4L4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pof1bQ8K4L4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Pof1bQ8K4L4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pof1bQ8K4L4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pof1bQ8K4L4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pof1bQ8K4L4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pof1bQ8K4L4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pof1bQ8K4L4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pof1bQ8K4L4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pof1bQ8K4L4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pof1bQ8K4L4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pof1bQ8K4L4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pof1bQ8K4L4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Pof1bQ8K4L4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pof1bQ8K4L4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pof1bQ8K4L4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pof1bQ8K4L4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pof1bQ8K4L4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Pof1bQ8K4L4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pof1bQ8K4L4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pof1bQ8K4L4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pof1bQ8K4L4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pof1bQ8K4L4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Pof1bQ8K4L4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pof1bQ8K4L4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pof1bQ8K4L4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pof1bQ8K4L4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pof1bQ8K4L4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pof1bQ8K4L4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Pof1bQ8K4L4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pof1bQ8K4L4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pof1bQ8K4L4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pof1bQ8K4L4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pof1bQ8K4L4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pof1bQ8K4L4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pof1bQ8K4L4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pof1bQ8K4L4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pof1bQ8K4L4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pof1bQ8K4L4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pof1bQ8K4L4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pof1bQ8K4L4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pof1bQ8K4L4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pof1bQ8K4L4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pof1bQ8K4L4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pof1bQ8K4L4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pof1bQ8K4L4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pof1bQ8K4L4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pof1bQ8K4L4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pof1bQ8K4L4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pof1bQ8K4L4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pof1bQ8K4L4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pof1bQ8K4L4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pof1bQ8K4L4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pof1bQ8K4L4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pof1bQ8K4L4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pof1bQ8K4L4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pof1bQ8K4L4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pof1bQ8K4L4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pof1bQ8K4L4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Pof1bQ8K4L4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pof1bQ8K4L4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pof1bQ8K4L4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Pof1bQ8K4L4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pof1bQ8K4L4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pof1bQ8K4L4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pof1bQ8K4L4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pof1bQ8K4L4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pof1bQ8K4L4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pof1bQ8K4L4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pof1bQ8K4L4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pof1bQ8K4L4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pof1bQ8K4L4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pof1bQ8K4L4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pof1bQ8K4L4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pof1bQ8K4L4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pof1bQ8K4L4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pof1bQ8K4L4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pof1bQ8K4L4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pof1bQ8K4L4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pof1bQ8K4L4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pof1bQ8K4L4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Pof1bQ8K4L4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pof1bQ8K4L4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms