Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cnppd1Q8K158 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cnppd1Q8K158 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnppd1Q8K158 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnppd1Q8K158 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnppd1Q8K158 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnppd1Q8K158 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnppd1Q8K158 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnppd1Q8K158 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnppd1Q8K158 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnppd1Q8K158 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnppd1Q8K158 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnppd1Q8K158 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnppd1Q8K158 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnppd1Q8K158 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnppd1Q8K158 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnppd1Q8K158 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnppd1Q8K158 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnppd1Q8K158 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnppd1Q8K158 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnppd1Q8K158 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnppd1Q8K158 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnppd1Q8K158 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnppd1Q8K158 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnppd1Q8K158 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnppd1Q8K158 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnppd1Q8K158 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnppd1Q8K158 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnppd1Q8K158 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnppd1Q8K158 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnppd1Q8K158 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnppd1Q8K158 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnppd1Q8K158 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnppd1Q8K158 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnppd1Q8K158 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnppd1Q8K158 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnppd1Q8K158 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnppd1Q8K158 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnppd1Q8K158 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnppd1Q8K158 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnppd1Q8K158 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cnppd1Q8K158 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cnppd1Q8K158 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnppd1Q8K158 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnppd1Q8K158 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnppd1Q8K158 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnppd1Q8K158 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnppd1Q8K158 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnppd1Q8K158 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnppd1Q8K158 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnppd1Q8K158 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnppd1Q8K158 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnppd1Q8K158 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnppd1Q8K158 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnppd1Q8K158 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnppd1Q8K158 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnppd1Q8K158 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cnppd1Q8K158 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cnppd1Q8K158 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnppd1Q8K158 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnppd1Q8K158 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnppd1Q8K158 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnppd1Q8K158 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnppd1Q8K158 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnppd1Q8K158 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnppd1Q8K158 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnppd1Q8K158 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnppd1Q8K158 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnppd1Q8K158 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnppd1Q8K158 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnppd1Q8K158 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnppd1Q8K158 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnppd1Q8K158 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnppd1Q8K158 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnppd1Q8K158 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnppd1Q8K158 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnppd1Q8K158 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnppd1Q8K158 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnppd1Q8K158 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnppd1Q8K158 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnppd1Q8K158 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnppd1Q8K158 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnppd1Q8K158 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnppd1Q8K158 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnppd1Q8K158 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnppd1Q8K158 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnppd1Q8K158 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnppd1Q8K158 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnppd1Q8K158 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnppd1Q8K158 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnppd1Q8K158 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnppd1Q8K158 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnppd1Q8K158 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnppd1Q8K158 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnppd1Q8K158 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnppd1Q8K158 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnppd1Q8K158 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnppd1Q8K158 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnppd1Q8K158 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnppd1Q8K158 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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