Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rasgef1bQ8JZL7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rasgef1bQ8JZL7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rasgef1bQ8JZL7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rasgef1bQ8JZL7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rasgef1bQ8JZL7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rasgef1bQ8JZL7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rasgef1bQ8JZL7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rasgef1bQ8JZL7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rasgef1bQ8JZL7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rasgef1bQ8JZL7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rasgef1bQ8JZL7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rasgef1bQ8JZL7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rasgef1bQ8JZL7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rasgef1bQ8JZL7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rasgef1bQ8JZL7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rasgef1bQ8JZL7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rasgef1bQ8JZL7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rasgef1bQ8JZL7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rasgef1bQ8JZL7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rasgef1bQ8JZL7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rasgef1bQ8JZL7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rasgef1bQ8JZL7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rasgef1bQ8JZL7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rasgef1bQ8JZL7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rasgef1bQ8JZL7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rasgef1bQ8JZL7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rasgef1bQ8JZL7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rasgef1bQ8JZL7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rasgef1bQ8JZL7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rasgef1bQ8JZL7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rasgef1bQ8JZL7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rasgef1bQ8JZL7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rasgef1bQ8JZL7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Rasgef1bQ8JZL7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rasgef1bQ8JZL7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rasgef1bQ8JZL7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rasgef1bQ8JZL7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rasgef1bQ8JZL7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rasgef1bQ8JZL7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rasgef1bQ8JZL7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rasgef1bQ8JZL7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasgef1bQ8JZL7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasgef1bQ8JZL7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rasgef1bQ8JZL7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rasgef1bQ8JZL7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rasgef1bQ8JZL7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rasgef1bQ8JZL7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rasgef1bQ8JZL7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rasgef1bQ8JZL7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rasgef1bQ8JZL7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rasgef1bQ8JZL7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rasgef1bQ8JZL7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rasgef1bQ8JZL7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rasgef1bQ8JZL7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rasgef1bQ8JZL7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rasgef1bQ8JZL7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rasgef1bQ8JZL7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rasgef1bQ8JZL7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rasgef1bQ8JZL7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasgef1bQ8JZL7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasgef1bQ8JZL7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rasgef1bQ8JZL7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasgef1bQ8JZL7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasgef1bQ8JZL7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasgef1bQ8JZL7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasgef1bQ8JZL7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasgef1bQ8JZL7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasgef1bQ8JZL7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasgef1bQ8JZL7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasgef1bQ8JZL7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasgef1bQ8JZL7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rasgef1bQ8JZL7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rasgef1bQ8JZL7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rasgef1bQ8JZL7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rasgef1bQ8JZL7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasgef1bQ8JZL7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasgef1bQ8JZL7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasgef1bQ8JZL7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rasgef1bQ8JZL7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rasgef1bQ8JZL7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rasgef1bQ8JZL7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rasgef1bQ8JZL7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rasgef1bQ8JZL7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rasgef1bQ8JZL7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rasgef1bQ8JZL7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rasgef1bQ8JZL7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rasgef1bQ8JZL7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rasgef1bQ8JZL7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rasgef1bQ8JZL7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rasgef1bQ8JZL7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rasgef1bQ8JZL7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rasgef1bQ8JZL7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rasgef1bQ8JZL7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rasgef1bQ8JZL7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rasgef1bQ8JZL7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rasgef1bQ8JZL7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms