Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CMTM1Q8IZ96 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM1Q8IZ96 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM1Q8IZ96 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM1Q8IZ96 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM1Q8IZ96 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM1Q8IZ96 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM1Q8IZ96 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM1Q8IZ96 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM1Q8IZ96 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM1Q8IZ96 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM1Q8IZ96 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM1Q8IZ96 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM1Q8IZ96 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM1Q8IZ96 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMTM1Q8IZ96 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMTM1Q8IZ96 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMTM1Q8IZ96 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMTM1Q8IZ96 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMTM1Q8IZ96 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMTM1Q8IZ96 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMTM1Q8IZ96 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMTM1Q8IZ96 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMTM1Q8IZ96 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMTM1Q8IZ96 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CMTM1Q8IZ96 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CMTM1Q8IZ96 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMTM1Q8IZ96 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMTM1Q8IZ96 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMTM1Q8IZ96 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMTM1Q8IZ96 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMTM1Q8IZ96 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMTM1Q8IZ96 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMTM1Q8IZ96 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMTM1Q8IZ96 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMTM1Q8IZ96 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMTM1Q8IZ96 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMTM1Q8IZ96 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMTM1Q8IZ96 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMTM1Q8IZ96 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMTM1Q8IZ96 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMTM1Q8IZ96 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMTM1Q8IZ96 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMTM1Q8IZ96 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMTM1Q8IZ96 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMTM1Q8IZ96 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CMTM1Q8IZ96 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CMTM1Q8IZ96 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CMTM1Q8IZ96 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMTM1Q8IZ96 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMTM1Q8IZ96 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMTM1Q8IZ96 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMTM1Q8IZ96 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMTM1Q8IZ96 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMTM1Q8IZ96 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMTM1Q8IZ96 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMTM1Q8IZ96 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CMTM1Q8IZ96 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMTM1Q8IZ96 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMTM1Q8IZ96 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMTM1Q8IZ96 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMTM1Q8IZ96 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMTM1Q8IZ96 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMTM1Q8IZ96 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMTM1Q8IZ96 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMTM1Q8IZ96 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMTM1Q8IZ96 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMTM1Q8IZ96 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CMTM1Q8IZ96 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMTM1Q8IZ96 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMTM1Q8IZ96 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMTM1Q8IZ96 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMTM1Q8IZ96 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMTM1Q8IZ96 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMTM1Q8IZ96 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMTM1Q8IZ96 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMTM1Q8IZ96 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMTM1Q8IZ96 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CMTM1Q8IZ96 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM1Q8IZ96 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM1Q8IZ96 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMTM1Q8IZ96 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMTM1Q8IZ96 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMTM1Q8IZ96 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CMTM1Q8IZ96 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMTM1Q8IZ96 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMTM1Q8IZ96 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMTM1Q8IZ96 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMTM1Q8IZ96 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMTM1Q8IZ96 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMTM1Q8IZ96 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMTM1Q8IZ96 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMTM1Q8IZ96 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMTM1Q8IZ96 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMTM1Q8IZ96 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMTM1Q8IZ96 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMTM1Q8IZ96 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMTM1Q8IZ96 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMTM1Q8IZ96 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMTM1Q8IZ96 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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