Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HACE1Q8IYU2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HACE1Q8IYU2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HACE1Q8IYU2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HACE1Q8IYU2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HACE1Q8IYU2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HACE1Q8IYU2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HACE1Q8IYU2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HACE1Q8IYU2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HACE1Q8IYU2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
HACE1Q8IYU2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HACE1Q8IYU2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HACE1Q8IYU2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HACE1Q8IYU2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HACE1Q8IYU2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HACE1Q8IYU2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HACE1Q8IYU2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HACE1Q8IYU2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HACE1Q8IYU2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HACE1Q8IYU2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HACE1Q8IYU2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HACE1Q8IYU2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HACE1Q8IYU2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
HACE1Q8IYU2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HACE1Q8IYU2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HACE1Q8IYU2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HACE1Q8IYU2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HACE1Q8IYU2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HACE1Q8IYU2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
HACE1Q8IYU2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HACE1Q8IYU2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HACE1Q8IYU2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HACE1Q8IYU2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HACE1Q8IYU2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HACE1Q8IYU2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
HACE1Q8IYU2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HACE1Q8IYU2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HACE1Q8IYU2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HACE1Q8IYU2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HACE1Q8IYU2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HACE1Q8IYU2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HACE1Q8IYU2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HACE1Q8IYU2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HACE1Q8IYU2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HACE1Q8IYU2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
HACE1Q8IYU2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
HACE1Q8IYU2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
HACE1Q8IYU2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HACE1Q8IYU2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HACE1Q8IYU2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HACE1Q8IYU2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HACE1Q8IYU2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HACE1Q8IYU2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HACE1Q8IYU2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HACE1Q8IYU2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HACE1Q8IYU2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HACE1Q8IYU2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HACE1Q8IYU2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HACE1Q8IYU2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HACE1Q8IYU2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HACE1Q8IYU2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HACE1Q8IYU2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HACE1Q8IYU2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HACE1Q8IYU2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HACE1Q8IYU2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HACE1Q8IYU2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HACE1Q8IYU2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
HACE1Q8IYU2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HACE1Q8IYU2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
HACE1Q8IYU2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HACE1Q8IYU2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HACE1Q8IYU2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HACE1Q8IYU2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HACE1Q8IYU2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HACE1Q8IYU2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
HACE1Q8IYU2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HACE1Q8IYU2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HACE1Q8IYU2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
HACE1Q8IYU2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HACE1Q8IYU2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HACE1Q8IYU2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HACE1Q8IYU2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HACE1Q8IYU2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HACE1Q8IYU2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HACE1Q8IYU2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HACE1Q8IYU2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HACE1Q8IYU2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HACE1Q8IYU2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HACE1Q8IYU2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HACE1Q8IYU2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HACE1Q8IYU2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HACE1Q8IYU2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HACE1Q8IYU2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HACE1Q8IYU2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HACE1Q8IYU2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HACE1Q8IYU2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HACE1Q8IYU2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HACE1Q8IYU2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HACE1Q8IYU2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HACE1Q8IYU2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms