Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTN4Q8IWV2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTN4Q8IWV2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTN4Q8IWV2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTN4Q8IWV2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTN4Q8IWV2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTN4Q8IWV2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTN4Q8IWV2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTN4Q8IWV2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTN4Q8IWV2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTN4Q8IWV2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTN4Q8IWV2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTN4Q8IWV2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNTN4Q8IWV2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNTN4Q8IWV2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNTN4Q8IWV2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNTN4Q8IWV2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNTN4Q8IWV2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTN4Q8IWV2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTN4Q8IWV2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTN4Q8IWV2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTN4Q8IWV2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTN4Q8IWV2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTN4Q8IWV2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTN4Q8IWV2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTN4Q8IWV2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTN4Q8IWV2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTN4Q8IWV2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTN4Q8IWV2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTN4Q8IWV2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTN4Q8IWV2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTN4Q8IWV2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTN4Q8IWV2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTN4Q8IWV2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTN4Q8IWV2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTN4Q8IWV2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTN4Q8IWV2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTN4Q8IWV2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTN4Q8IWV2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTN4Q8IWV2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTN4Q8IWV2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTN4Q8IWV2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTN4Q8IWV2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTN4Q8IWV2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTN4Q8IWV2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTN4Q8IWV2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTN4Q8IWV2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTN4Q8IWV2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTN4Q8IWV2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTN4Q8IWV2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTN4Q8IWV2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTN4Q8IWV2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTN4Q8IWV2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTN4Q8IWV2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTN4Q8IWV2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTN4Q8IWV2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTN4Q8IWV2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTN4Q8IWV2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTN4Q8IWV2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTN4Q8IWV2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTN4Q8IWV2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTN4Q8IWV2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTN4Q8IWV2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTN4Q8IWV2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTN4Q8IWV2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTN4Q8IWV2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTN4Q8IWV2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTN4Q8IWV2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNTN4Q8IWV2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CNTN4Q8IWV2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CNTN4Q8IWV2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CNTN4Q8IWV2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CNTN4Q8IWV2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTN4Q8IWV2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTN4Q8IWV2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTN4Q8IWV2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTN4Q8IWV2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTN4Q8IWV2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTN4Q8IWV2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN4Q8IWV2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN4Q8IWV2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN4Q8IWV2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN4Q8IWV2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN4Q8IWV2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN4Q8IWV2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN4Q8IWV2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN4Q8IWV2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN4Q8IWV2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN4Q8IWV2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN4Q8IWV2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNTN4Q8IWV2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTN4Q8IWV2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTN4Q8IWV2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN4Q8IWV2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN4Q8IWV2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN4Q8IWV2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN4Q8IWV2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN4Q8IWV2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN4Q8IWV2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTN4Q8IWV2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.7 ms