Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT6

LRRC8A, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8AQ8IWT6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC8AQ8IWT6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC8AQ8IWT6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC8AQ8IWT6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC8AQ8IWT6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC8AQ8IWT6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC8AQ8IWT6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC8AQ8IWT6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC8AQ8IWT6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC8AQ8IWT6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC8AQ8IWT6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC8AQ8IWT6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC8AQ8IWT6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC8AQ8IWT6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC8AQ8IWT6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC8AQ8IWT6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC8AQ8IWT6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC8AQ8IWT6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC8AQ8IWT6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC8AQ8IWT6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC8AQ8IWT6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC8AQ8IWT6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC8AQ8IWT6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC8AQ8IWT6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC8AQ8IWT6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC8AQ8IWT6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC8AQ8IWT6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC8AQ8IWT6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC8AQ8IWT6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LRRC8AQ8IWT6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LRRC8AQ8IWT6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC8AQ8IWT6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC8AQ8IWT6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC8AQ8IWT6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC8AQ8IWT6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC8AQ8IWT6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC8AQ8IWT6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC8AQ8IWT6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC8AQ8IWT6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC8AQ8IWT6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC8AQ8IWT6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC8AQ8IWT6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC8AQ8IWT6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC8AQ8IWT6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC8AQ8IWT6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC8AQ8IWT6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC8AQ8IWT6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC8AQ8IWT6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC8AQ8IWT6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC8AQ8IWT6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC8AQ8IWT6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC8AQ8IWT6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC8AQ8IWT6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC8AQ8IWT6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC8AQ8IWT6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC8AQ8IWT6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC8AQ8IWT6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC8AQ8IWT6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC8AQ8IWT6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC8AQ8IWT6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC8AQ8IWT6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC8AQ8IWT6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC8AQ8IWT6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC8AQ8IWT6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC8AQ8IWT6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC8AQ8IWT6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC8AQ8IWT6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC8AQ8IWT6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC8AQ8IWT6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC8AQ8IWT6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC8AQ8IWT6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC8AQ8IWT6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC8AQ8IWT6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC8AQ8IWT6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC8AQ8IWT6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC8AQ8IWT6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC8AQ8IWT6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC8AQ8IWT6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC8AQ8IWT6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC8AQ8IWT6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC8AQ8IWT6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC8AQ8IWT6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC8AQ8IWT6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC8AQ8IWT6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC8AQ8IWT6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC8AQ8IWT6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC8AQ8IWT6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC8AQ8IWT6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC8AQ8IWT6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC8AQ8IWT6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC8AQ8IWT6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC8AQ8IWT6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC8AQ8IWT6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC8AQ8IWT6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC8AQ8IWT6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC8AQ8IWT6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC8AQ8IWT6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC8AQ8IWT6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC8AQ8IWT6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC8AQ8IWT6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms