Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW6

ARID3B, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3BQ8IVW6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID3BQ8IVW6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3BQ8IVW6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3BQ8IVW6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3BQ8IVW6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID3BQ8IVW6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARID3BQ8IVW6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID3BQ8IVW6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARID3BQ8IVW6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARID3BQ8IVW6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARID3BQ8IVW6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARID3BQ8IVW6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARID3BQ8IVW6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARID3BQ8IVW6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID3BQ8IVW6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID3BQ8IVW6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID3BQ8IVW6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID3BQ8IVW6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID3BQ8IVW6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARID3BQ8IVW6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARID3BQ8IVW6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID3BQ8IVW6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID3BQ8IVW6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID3BQ8IVW6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID3BQ8IVW6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARID3BQ8IVW6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID3BQ8IVW6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID3BQ8IVW6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID3BQ8IVW6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID3BQ8IVW6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID3BQ8IVW6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID3BQ8IVW6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID3BQ8IVW6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3BQ8IVW6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3BQ8IVW6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3BQ8IVW6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3BQ8IVW6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3BQ8IVW6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3BQ8IVW6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3BQ8IVW6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARID3BQ8IVW6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ARID3BQ8IVW6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ARID3BQ8IVW6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ARID3BQ8IVW6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARID3BQ8IVW6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARID3BQ8IVW6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARID3BQ8IVW6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ARID3BQ8IVW6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARID3BQ8IVW6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARID3BQ8IVW6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARID3BQ8IVW6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ARID3BQ8IVW6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3BQ8IVW6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3BQ8IVW6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3BQ8IVW6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3BQ8IVW6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3BQ8IVW6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ARID3BQ8IVW6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ARID3BQ8IVW6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ARID3BQ8IVW6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID3BQ8IVW6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID3BQ8IVW6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID3BQ8IVW6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID3BQ8IVW6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID3BQ8IVW6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID3BQ8IVW6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID3BQ8IVW6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID3BQ8IVW6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID3BQ8IVW6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID3BQ8IVW6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID3BQ8IVW6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID3BQ8IVW6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID3BQ8IVW6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3BQ8IVW6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID3BQ8IVW6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARID3BQ8IVW6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARID3BQ8IVW6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID3BQ8IVW6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID3BQ8IVW6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID3BQ8IVW6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID3BQ8IVW6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID3BQ8IVW6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID3BQ8IVW6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID3BQ8IVW6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID3BQ8IVW6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID3BQ8IVW6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID3BQ8IVW6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID3BQ8IVW6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID3BQ8IVW6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID3BQ8IVW6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID3BQ8IVW6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID3BQ8IVW6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID3BQ8IVW6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID3BQ8IVW6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID3BQ8IVW6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID3BQ8IVW6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID3BQ8IVW6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID3BQ8IVW6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARID3BQ8IVW6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ARID3BQ8IVW6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms