Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KSR1Q8IVT5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KSR1Q8IVT5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KSR1Q8IVT5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KSR1Q8IVT5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KSR1Q8IVT5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KSR1Q8IVT5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KSR1Q8IVT5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KSR1Q8IVT5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KSR1Q8IVT5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KSR1Q8IVT5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KSR1Q8IVT5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KSR1Q8IVT5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KSR1Q8IVT5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KSR1Q8IVT5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KSR1Q8IVT5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KSR1Q8IVT5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KSR1Q8IVT5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KSR1Q8IVT5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KSR1Q8IVT5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KSR1Q8IVT5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
KSR1Q8IVT5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KSR1Q8IVT5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
KSR1Q8IVT5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KSR1Q8IVT5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KSR1Q8IVT5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KSR1Q8IVT5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KSR1Q8IVT5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KSR1Q8IVT5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KSR1Q8IVT5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KSR1Q8IVT5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KSR1Q8IVT5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KSR1Q8IVT5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
KSR1Q8IVT5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KSR1Q8IVT5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KSR1Q8IVT5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KSR1Q8IVT5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KSR1Q8IVT5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KSR1Q8IVT5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KSR1Q8IVT5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KSR1Q8IVT5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
KSR1Q8IVT5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
KSR1Q8IVT5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
KSR1Q8IVT5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
KSR1Q8IVT5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
KSR1Q8IVT5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KSR1Q8IVT5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KSR1Q8IVT5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KSR1Q8IVT5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KSR1Q8IVT5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KSR1Q8IVT5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KSR1Q8IVT5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KSR1Q8IVT5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
KSR1Q8IVT5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KSR1Q8IVT5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KSR1Q8IVT5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KSR1Q8IVT5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KSR1Q8IVT5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KSR1Q8IVT5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KSR1Q8IVT5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KSR1Q8IVT5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KSR1Q8IVT5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KSR1Q8IVT5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KSR1Q8IVT5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KSR1Q8IVT5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KSR1Q8IVT5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KSR1Q8IVT5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KSR1Q8IVT5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KSR1Q8IVT5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
KSR1Q8IVT5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KSR1Q8IVT5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KSR1Q8IVT5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KSR1Q8IVT5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KSR1Q8IVT5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KSR1Q8IVT5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KSR1Q8IVT5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
KSR1Q8IVT5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KSR1Q8IVT5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KSR1Q8IVT5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KSR1Q8IVT5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KSR1Q8IVT5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KSR1Q8IVT5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KSR1Q8IVT5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KSR1Q8IVT5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KSR1Q8IVT5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KSR1Q8IVT5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KSR1Q8IVT5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KSR1Q8IVT5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KSR1Q8IVT5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KSR1Q8IVT5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KSR1Q8IVT5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KSR1Q8IVT5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KSR1Q8IVT5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KSR1Q8IVT5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KSR1Q8IVT5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KSR1Q8IVT5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KSR1Q8IVT5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KSR1Q8IVT5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KSR1Q8IVT5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KSR1Q8IVT5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms