Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIA5

Slc35b4, UDP-xylose and UDP-N-acetylglucosamine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35b4Q8CIA5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc35b4Q8CIA5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc35b4Q8CIA5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc35b4Q8CIA5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Slc35b4Q8CIA5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc35b4Q8CIA5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc35b4Q8CIA5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc35b4Q8CIA5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc35b4Q8CIA5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc35b4Q8CIA5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc35b4Q8CIA5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc35b4Q8CIA5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Slc35b4Q8CIA5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc35b4Q8CIA5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc35b4Q8CIA5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc35b4Q8CIA5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc35b4Q8CIA5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc35b4Q8CIA5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc35b4Q8CIA5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc35b4Q8CIA5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc35b4Q8CIA5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc35b4Q8CIA5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc35b4Q8CIA5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc35b4Q8CIA5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc35b4Q8CIA5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc35b4Q8CIA5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc35b4Q8CIA5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc35b4Q8CIA5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc35b4Q8CIA5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc35b4Q8CIA5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc35b4Q8CIA5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc35b4Q8CIA5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc35b4Q8CIA5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc35b4Q8CIA5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc35b4Q8CIA5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc35b4Q8CIA5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc35b4Q8CIA5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc35b4Q8CIA5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc35b4Q8CIA5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc35b4Q8CIA5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc35b4Q8CIA5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc35b4Q8CIA5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc35b4Q8CIA5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc35b4Q8CIA5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc35b4Q8CIA5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc35b4Q8CIA5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc35b4Q8CIA5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc35b4Q8CIA5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc35b4Q8CIA5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc35b4Q8CIA5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc35b4Q8CIA5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc35b4Q8CIA5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc35b4Q8CIA5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc35b4Q8CIA5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc35b4Q8CIA5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc35b4Q8CIA5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc35b4Q8CIA5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc35b4Q8CIA5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc35b4Q8CIA5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc35b4Q8CIA5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc35b4Q8CIA5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc35b4Q8CIA5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc35b4Q8CIA5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc35b4Q8CIA5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc35b4Q8CIA5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc35b4Q8CIA5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc35b4Q8CIA5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc35b4Q8CIA5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc35b4Q8CIA5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc35b4Q8CIA5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc35b4Q8CIA5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc35b4Q8CIA5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc35b4Q8CIA5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc35b4Q8CIA5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc35b4Q8CIA5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc35b4Q8CIA5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc35b4Q8CIA5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc35b4Q8CIA5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc35b4Q8CIA5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc35b4Q8CIA5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc35b4Q8CIA5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc35b4Q8CIA5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc35b4Q8CIA5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc35b4Q8CIA5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc35b4Q8CIA5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc35b4Q8CIA5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc35b4Q8CIA5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc35b4Q8CIA5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc35b4Q8CIA5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc35b4Q8CIA5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc35b4Q8CIA5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc35b4Q8CIA5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc35b4Q8CIA5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc35b4Q8CIA5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc35b4Q8CIA5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc35b4Q8CIA5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc35b4Q8CIA5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc35b4Q8CIA5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc35b4Q8CIA5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc35b4Q8CIA5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms