Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1l1Q8CGM2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rp1l1Q8CGM2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rp1l1Q8CGM2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rp1l1Q8CGM2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rp1l1Q8CGM2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rp1l1Q8CGM2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rp1l1Q8CGM2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rp1l1Q8CGM2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rp1l1Q8CGM2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rp1l1Q8CGM2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rp1l1Q8CGM2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rp1l1Q8CGM2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rp1l1Q8CGM2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rp1l1Q8CGM2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rp1l1Q8CGM2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rp1l1Q8CGM2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Rp1l1Q8CGM2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rp1l1Q8CGM2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rp1l1Q8CGM2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rp1l1Q8CGM2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Rp1l1Q8CGM2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rp1l1Q8CGM2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rp1l1Q8CGM2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Rp1l1Q8CGM2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rp1l1Q8CGM2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rp1l1Q8CGM2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rp1l1Q8CGM2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Rp1l1Q8CGM2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rp1l1Q8CGM2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rp1l1Q8CGM2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rp1l1Q8CGM2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rp1l1Q8CGM2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rp1l1Q8CGM2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rp1l1Q8CGM2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rp1l1Q8CGM2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rp1l1Q8CGM2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rp1l1Q8CGM2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rp1l1Q8CGM2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Rp1l1Q8CGM2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rp1l1Q8CGM2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rp1l1Q8CGM2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rp1l1Q8CGM2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rp1l1Q8CGM2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rp1l1Q8CGM2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rp1l1Q8CGM2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rp1l1Q8CGM2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rp1l1Q8CGM2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rp1l1Q8CGM2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rp1l1Q8CGM2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rp1l1Q8CGM2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rp1l1Q8CGM2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rp1l1Q8CGM2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rp1l1Q8CGM2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rp1l1Q8CGM2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rp1l1Q8CGM2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rp1l1Q8CGM2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rp1l1Q8CGM2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rp1l1Q8CGM2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rp1l1Q8CGM2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rp1l1Q8CGM2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rp1l1Q8CGM2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rp1l1Q8CGM2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rp1l1Q8CGM2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rp1l1Q8CGM2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rp1l1Q8CGM2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rp1l1Q8CGM2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rp1l1Q8CGM2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rp1l1Q8CGM2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rp1l1Q8CGM2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rp1l1Q8CGM2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rp1l1Q8CGM2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rp1l1Q8CGM2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rp1l1Q8CGM2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rp1l1Q8CGM2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rp1l1Q8CGM2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rp1l1Q8CGM2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rp1l1Q8CGM2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rp1l1Q8CGM2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rp1l1Q8CGM2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rp1l1Q8CGM2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rp1l1Q8CGM2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rp1l1Q8CGM2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rp1l1Q8CGM2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rp1l1Q8CGM2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rp1l1Q8CGM2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rp1l1Q8CGM2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rp1l1Q8CGM2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rp1l1Q8CGM2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rp1l1Q8CGM2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rp1l1Q8CGM2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rp1l1Q8CGM2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Rp1l1Q8CGM2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rp1l1Q8CGM2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rp1l1Q8CGM2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rp1l1Q8CGM2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rp1l1Q8CGM2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rp1l1Q8CGM2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rp1l1Q8CGM2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rp1l1Q8CGM2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rp1l1Q8CGM2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms