Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Setd1bQ8CFT2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Setd1bQ8CFT2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Setd1bQ8CFT2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Setd1bQ8CFT2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Setd1bQ8CFT2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Setd1bQ8CFT2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Setd1bQ8CFT2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Setd1bQ8CFT2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Setd1bQ8CFT2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
Setd1bQ8CFT2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Setd1bQ8CFT2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Setd1bQ8CFT2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Setd1bQ8CFT2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Setd1bQ8CFT2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Setd1bQ8CFT2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
Setd1bQ8CFT2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
Setd1bQ8CFT2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
Setd1bQ8CFT2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC40.06■■■■■ 4
Setd1bQ8CFT2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Setd1bQ8CFT2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Setd1bQ8CFT2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Setd1bQ8CFT2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
Setd1bQ8CFT2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Setd1bQ8CFT2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
Setd1bQ8CFT2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Setd1bQ8CFT2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC40.01■■■■□ 3.99
Setd1bQ8CFT2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC40.01■■■■□ 3.99
Setd1bQ8CFT2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Setd1bQ8CFT2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Setd1bQ8CFT2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Setd1bQ8CFT2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
Setd1bQ8CFT2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Setd1bQ8CFT2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
Setd1bQ8CFT2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Setd1bQ8CFT2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Setd1bQ8CFT2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Setd1bQ8CFT2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Setd1bQ8CFT2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
Setd1bQ8CFT2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Setd1bQ8CFT2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Setd1bQ8CFT2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Setd1bQ8CFT2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Setd1bQ8CFT2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
Setd1bQ8CFT2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Setd1bQ8CFT2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
Setd1bQ8CFT2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Setd1bQ8CFT2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Setd1bQ8CFT2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Setd1bQ8CFT2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Setd1bQ8CFT2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
Setd1bQ8CFT2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Setd1bQ8CFT2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
Setd1bQ8CFT2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Setd1bQ8CFT2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Setd1bQ8CFT2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Setd1bQ8CFT2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Setd1bQ8CFT2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Setd1bQ8CFT2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
Setd1bQ8CFT2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Setd1bQ8CFT2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC39.72■■■■□ 3.95
Setd1bQ8CFT2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Setd1bQ8CFT2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Setd1bQ8CFT2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Setd1bQ8CFT2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Setd1bQ8CFT2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Setd1bQ8CFT2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC39.66■■■■□ 3.94
Setd1bQ8CFT2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Setd1bQ8CFT2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Setd1bQ8CFT2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Setd1bQ8CFT2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
Setd1bQ8CFT2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Setd1bQ8CFT2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Setd1bQ8CFT2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Setd1bQ8CFT2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Setd1bQ8CFT2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Setd1bQ8CFT2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Setd1bQ8CFT2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Setd1bQ8CFT2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
Setd1bQ8CFT2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
Setd1bQ8CFT2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
Setd1bQ8CFT2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
Setd1bQ8CFT2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
Setd1bQ8CFT2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Setd1bQ8CFT2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Setd1bQ8CFT2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Setd1bQ8CFT2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Setd1bQ8CFT2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Setd1bQ8CFT2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Setd1bQ8CFT2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Setd1bQ8CFT2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Setd1bQ8CFT2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Setd1bQ8CFT2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Setd1bQ8CFT2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Setd1bQ8CFT2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Setd1bQ8CFT2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Setd1bQ8CFT2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC39.52■■■■□ 3.92
Setd1bQ8CFT2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Setd1bQ8CFT2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Setd1bQ8CFT2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms