Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc28bQ8CEG5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc28bQ8CEG5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc28bQ8CEG5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc28bQ8CEG5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc28bQ8CEG5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc28bQ8CEG5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc28bQ8CEG5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc28bQ8CEG5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc28bQ8CEG5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc28bQ8CEG5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc28bQ8CEG5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc28bQ8CEG5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc28bQ8CEG5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc28bQ8CEG5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc28bQ8CEG5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc28bQ8CEG5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc28bQ8CEG5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc28bQ8CEG5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc28bQ8CEG5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc28bQ8CEG5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc28bQ8CEG5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc28bQ8CEG5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc28bQ8CEG5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc28bQ8CEG5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc28bQ8CEG5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc28bQ8CEG5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc28bQ8CEG5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc28bQ8CEG5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc28bQ8CEG5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc28bQ8CEG5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc28bQ8CEG5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc28bQ8CEG5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc28bQ8CEG5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc28bQ8CEG5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc28bQ8CEG5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc28bQ8CEG5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc28bQ8CEG5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc28bQ8CEG5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc28bQ8CEG5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc28bQ8CEG5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc28bQ8CEG5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc28bQ8CEG5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc28bQ8CEG5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc28bQ8CEG5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc28bQ8CEG5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc28bQ8CEG5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc28bQ8CEG5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc28bQ8CEG5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc28bQ8CEG5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc28bQ8CEG5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc28bQ8CEG5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc28bQ8CEG5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc28bQ8CEG5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc28bQ8CEG5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc28bQ8CEG5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc28bQ8CEG5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc28bQ8CEG5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc28bQ8CEG5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc28bQ8CEG5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc28bQ8CEG5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc28bQ8CEG5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc28bQ8CEG5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc28bQ8CEG5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc28bQ8CEG5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc28bQ8CEG5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc28bQ8CEG5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc28bQ8CEG5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc28bQ8CEG5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc28bQ8CEG5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc28bQ8CEG5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc28bQ8CEG5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc28bQ8CEG5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc28bQ8CEG5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc28bQ8CEG5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc28bQ8CEG5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc28bQ8CEG5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc28bQ8CEG5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc28bQ8CEG5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc28bQ8CEG5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc28bQ8CEG5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc28bQ8CEG5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc28bQ8CEG5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc28bQ8CEG5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc28bQ8CEG5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc28bQ8CEG5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc28bQ8CEG5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc28bQ8CEG5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc28bQ8CEG5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc28bQ8CEG5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc28bQ8CEG5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc28bQ8CEG5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc28bQ8CEG5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc28bQ8CEG5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc28bQ8CEG5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms