Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkiras1Q8CEC5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkiras1Q8CEC5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkiras1Q8CEC5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkiras1Q8CEC5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkiras1Q8CEC5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkiras1Q8CEC5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkiras1Q8CEC5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkiras1Q8CEC5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkiras1Q8CEC5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkiras1Q8CEC5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkiras1Q8CEC5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkiras1Q8CEC5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkiras1Q8CEC5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkiras1Q8CEC5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkiras1Q8CEC5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkiras1Q8CEC5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkiras1Q8CEC5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkiras1Q8CEC5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkiras1Q8CEC5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkiras1Q8CEC5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkiras1Q8CEC5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkiras1Q8CEC5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkiras1Q8CEC5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkiras1Q8CEC5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkiras1Q8CEC5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkiras1Q8CEC5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkiras1Q8CEC5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkiras1Q8CEC5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkiras1Q8CEC5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkiras1Q8CEC5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkiras1Q8CEC5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkiras1Q8CEC5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nkiras1Q8CEC5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkiras1Q8CEC5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Nkiras1Q8CEC5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkiras1Q8CEC5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkiras1Q8CEC5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkiras1Q8CEC5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkiras1Q8CEC5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkiras1Q8CEC5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkiras1Q8CEC5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkiras1Q8CEC5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkiras1Q8CEC5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkiras1Q8CEC5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkiras1Q8CEC5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkiras1Q8CEC5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkiras1Q8CEC5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkiras1Q8CEC5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkiras1Q8CEC5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkiras1Q8CEC5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkiras1Q8CEC5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkiras1Q8CEC5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkiras1Q8CEC5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkiras1Q8CEC5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkiras1Q8CEC5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkiras1Q8CEC5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nkiras1Q8CEC5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkiras1Q8CEC5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkiras1Q8CEC5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkiras1Q8CEC5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkiras1Q8CEC5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkiras1Q8CEC5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkiras1Q8CEC5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkiras1Q8CEC5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkiras1Q8CEC5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkiras1Q8CEC5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkiras1Q8CEC5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkiras1Q8CEC5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkiras1Q8CEC5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkiras1Q8CEC5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkiras1Q8CEC5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkiras1Q8CEC5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkiras1Q8CEC5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkiras1Q8CEC5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nkiras1Q8CEC5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nkiras1Q8CEC5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkiras1Q8CEC5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkiras1Q8CEC5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkiras1Q8CEC5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkiras1Q8CEC5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkiras1Q8CEC5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkiras1Q8CEC5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkiras1Q8CEC5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkiras1Q8CEC5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkiras1Q8CEC5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkiras1Q8CEC5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkiras1Q8CEC5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkiras1Q8CEC5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkiras1Q8CEC5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkiras1Q8CEC5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkiras1Q8CEC5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkiras1Q8CEC5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkiras1Q8CEC5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkiras1Q8CEC5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkiras1Q8CEC5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkiras1Q8CEC5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkiras1Q8CEC5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkiras1Q8CEC5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkiras1Q8CEC5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms