Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB96

Rassf4, Ras association domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf4Q8CB96 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rassf4Q8CB96 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rassf4Q8CB96 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rassf4Q8CB96 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rassf4Q8CB96 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rassf4Q8CB96 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rassf4Q8CB96 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rassf4Q8CB96 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rassf4Q8CB96 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rassf4Q8CB96 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rassf4Q8CB96 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rassf4Q8CB96 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rassf4Q8CB96 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rassf4Q8CB96 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rassf4Q8CB96 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rassf4Q8CB96 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rassf4Q8CB96 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rassf4Q8CB96 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rassf4Q8CB96 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rassf4Q8CB96 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rassf4Q8CB96 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rassf4Q8CB96 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rassf4Q8CB96 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rassf4Q8CB96 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rassf4Q8CB96 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rassf4Q8CB96 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rassf4Q8CB96 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rassf4Q8CB96 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rassf4Q8CB96 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rassf4Q8CB96 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rassf4Q8CB96 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rassf4Q8CB96 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rassf4Q8CB96 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rassf4Q8CB96 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rassf4Q8CB96 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rassf4Q8CB96 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rassf4Q8CB96 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rassf4Q8CB96 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rassf4Q8CB96 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Rassf4Q8CB96 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rassf4Q8CB96 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rassf4Q8CB96 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rassf4Q8CB96 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rassf4Q8CB96 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rassf4Q8CB96 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rassf4Q8CB96 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rassf4Q8CB96 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rassf4Q8CB96 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rassf4Q8CB96 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rassf4Q8CB96 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rassf4Q8CB96 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rassf4Q8CB96 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rassf4Q8CB96 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rassf4Q8CB96 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rassf4Q8CB96 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rassf4Q8CB96 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rassf4Q8CB96 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rassf4Q8CB96 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rassf4Q8CB96 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rassf4Q8CB96 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rassf4Q8CB96 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rassf4Q8CB96 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rassf4Q8CB96 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rassf4Q8CB96 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rassf4Q8CB96 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rassf4Q8CB96 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rassf4Q8CB96 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rassf4Q8CB96 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rassf4Q8CB96 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rassf4Q8CB96 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rassf4Q8CB96 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rassf4Q8CB96 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rassf4Q8CB96 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rassf4Q8CB96 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rassf4Q8CB96 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rassf4Q8CB96 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rassf4Q8CB96 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rassf4Q8CB96 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rassf4Q8CB96 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rassf4Q8CB96 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rassf4Q8CB96 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rassf4Q8CB96 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rassf4Q8CB96 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rassf4Q8CB96 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rassf4Q8CB96 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rassf4Q8CB96 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rassf4Q8CB96 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rassf4Q8CB96 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rassf4Q8CB96 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rassf4Q8CB96 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rassf4Q8CB96 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rassf4Q8CB96 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rassf4Q8CB96 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rassf4Q8CB96 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rassf4Q8CB96 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rassf4Q8CB96 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rassf4Q8CB96 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rassf4Q8CB96 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rassf4Q8CB96 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rassf4Q8CB96 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms