Protein–RNA interactions for Protein: Q8C966

Phf21b, PHD finger protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf21bQ8C966 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phf21bQ8C966 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phf21bQ8C966 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phf21bQ8C966 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phf21bQ8C966 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phf21bQ8C966 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phf21bQ8C966 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phf21bQ8C966 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Phf21bQ8C966 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Phf21bQ8C966 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phf21bQ8C966 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phf21bQ8C966 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phf21bQ8C966 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phf21bQ8C966 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phf21bQ8C966 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phf21bQ8C966 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Phf21bQ8C966 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phf21bQ8C966 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phf21bQ8C966 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phf21bQ8C966 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phf21bQ8C966 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phf21bQ8C966 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phf21bQ8C966 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf21bQ8C966 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf21bQ8C966 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf21bQ8C966 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf21bQ8C966 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phf21bQ8C966 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phf21bQ8C966 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phf21bQ8C966 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Phf21bQ8C966 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phf21bQ8C966 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phf21bQ8C966 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Phf21bQ8C966 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phf21bQ8C966 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phf21bQ8C966 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phf21bQ8C966 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf21bQ8C966 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf21bQ8C966 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf21bQ8C966 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf21bQ8C966 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf21bQ8C966 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf21bQ8C966 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf21bQ8C966 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phf21bQ8C966 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phf21bQ8C966 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phf21bQ8C966 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phf21bQ8C966 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phf21bQ8C966 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phf21bQ8C966 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phf21bQ8C966 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phf21bQ8C966 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phf21bQ8C966 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phf21bQ8C966 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phf21bQ8C966 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phf21bQ8C966 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phf21bQ8C966 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phf21bQ8C966 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phf21bQ8C966 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phf21bQ8C966 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phf21bQ8C966 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phf21bQ8C966 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phf21bQ8C966 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phf21bQ8C966 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phf21bQ8C966 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phf21bQ8C966 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phf21bQ8C966 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phf21bQ8C966 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phf21bQ8C966 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phf21bQ8C966 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phf21bQ8C966 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phf21bQ8C966 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phf21bQ8C966 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phf21bQ8C966 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phf21bQ8C966 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phf21bQ8C966 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Phf21bQ8C966 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phf21bQ8C966 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phf21bQ8C966 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phf21bQ8C966 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phf21bQ8C966 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phf21bQ8C966 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phf21bQ8C966 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phf21bQ8C966 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phf21bQ8C966 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phf21bQ8C966 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phf21bQ8C966 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phf21bQ8C966 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phf21bQ8C966 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phf21bQ8C966 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Phf21bQ8C966 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phf21bQ8C966 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phf21bQ8C966 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phf21bQ8C966 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phf21bQ8C966 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Phf21bQ8C966 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phf21bQ8C966 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phf21bQ8C966 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phf21bQ8C966 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phf21bQ8C966 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms