Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclre1bQ8C7W7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclre1bQ8C7W7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclre1bQ8C7W7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclre1bQ8C7W7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dclre1bQ8C7W7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dclre1bQ8C7W7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dclre1bQ8C7W7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dclre1bQ8C7W7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dclre1bQ8C7W7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dclre1bQ8C7W7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dclre1bQ8C7W7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dclre1bQ8C7W7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dclre1bQ8C7W7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dclre1bQ8C7W7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Dclre1bQ8C7W7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dclre1bQ8C7W7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dclre1bQ8C7W7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dclre1bQ8C7W7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dclre1bQ8C7W7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Dclre1bQ8C7W7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dclre1bQ8C7W7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dclre1bQ8C7W7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dclre1bQ8C7W7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dclre1bQ8C7W7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dclre1bQ8C7W7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dclre1bQ8C7W7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Dclre1bQ8C7W7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dclre1bQ8C7W7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dclre1bQ8C7W7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dclre1bQ8C7W7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dclre1bQ8C7W7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dclre1bQ8C7W7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dclre1bQ8C7W7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dclre1bQ8C7W7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dclre1bQ8C7W7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dclre1bQ8C7W7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dclre1bQ8C7W7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dclre1bQ8C7W7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dclre1bQ8C7W7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Dclre1bQ8C7W7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dclre1bQ8C7W7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dclre1bQ8C7W7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dclre1bQ8C7W7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dclre1bQ8C7W7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dclre1bQ8C7W7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dclre1bQ8C7W7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dclre1bQ8C7W7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dclre1bQ8C7W7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dclre1bQ8C7W7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dclre1bQ8C7W7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dclre1bQ8C7W7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dclre1bQ8C7W7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dclre1bQ8C7W7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dclre1bQ8C7W7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dclre1bQ8C7W7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dclre1bQ8C7W7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dclre1bQ8C7W7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dclre1bQ8C7W7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dclre1bQ8C7W7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dclre1bQ8C7W7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dclre1bQ8C7W7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Dclre1bQ8C7W7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dclre1bQ8C7W7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dclre1bQ8C7W7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dclre1bQ8C7W7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dclre1bQ8C7W7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dclre1bQ8C7W7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dclre1bQ8C7W7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dclre1bQ8C7W7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dclre1bQ8C7W7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dclre1bQ8C7W7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dclre1bQ8C7W7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dclre1bQ8C7W7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dclre1bQ8C7W7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dclre1bQ8C7W7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dclre1bQ8C7W7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dclre1bQ8C7W7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dclre1bQ8C7W7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dclre1bQ8C7W7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dclre1bQ8C7W7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Dclre1bQ8C7W7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dclre1bQ8C7W7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dclre1bQ8C7W7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dclre1bQ8C7W7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dclre1bQ8C7W7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dclre1bQ8C7W7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dclre1bQ8C7W7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dclre1bQ8C7W7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dclre1bQ8C7W7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Dclre1bQ8C7W7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dclre1bQ8C7W7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dclre1bQ8C7W7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dclre1bQ8C7W7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dclre1bQ8C7W7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dclre1bQ8C7W7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dclre1bQ8C7W7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dclre1bQ8C7W7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dclre1bQ8C7W7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms