Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp20Q8C6M1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp20Q8C6M1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp20Q8C6M1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp20Q8C6M1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp20Q8C6M1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp20Q8C6M1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp20Q8C6M1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp20Q8C6M1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp20Q8C6M1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp20Q8C6M1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp20Q8C6M1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp20Q8C6M1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp20Q8C6M1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp20Q8C6M1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp20Q8C6M1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp20Q8C6M1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp20Q8C6M1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp20Q8C6M1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp20Q8C6M1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp20Q8C6M1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp20Q8C6M1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp20Q8C6M1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp20Q8C6M1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp20Q8C6M1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp20Q8C6M1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Usp20Q8C6M1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp20Q8C6M1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp20Q8C6M1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp20Q8C6M1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp20Q8C6M1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp20Q8C6M1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp20Q8C6M1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp20Q8C6M1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Usp20Q8C6M1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp20Q8C6M1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp20Q8C6M1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp20Q8C6M1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp20Q8C6M1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp20Q8C6M1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp20Q8C6M1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp20Q8C6M1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp20Q8C6M1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp20Q8C6M1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp20Q8C6M1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp20Q8C6M1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp20Q8C6M1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp20Q8C6M1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp20Q8C6M1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp20Q8C6M1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp20Q8C6M1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp20Q8C6M1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp20Q8C6M1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp20Q8C6M1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp20Q8C6M1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp20Q8C6M1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp20Q8C6M1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp20Q8C6M1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp20Q8C6M1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp20Q8C6M1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp20Q8C6M1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp20Q8C6M1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp20Q8C6M1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp20Q8C6M1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp20Q8C6M1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp20Q8C6M1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp20Q8C6M1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp20Q8C6M1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp20Q8C6M1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp20Q8C6M1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp20Q8C6M1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp20Q8C6M1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp20Q8C6M1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp20Q8C6M1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp20Q8C6M1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp20Q8C6M1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp20Q8C6M1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp20Q8C6M1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp20Q8C6M1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp20Q8C6M1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp20Q8C6M1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp20Q8C6M1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
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