Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bhlhe22Q8C6A8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Bhlhe22Q8C6A8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bhlhe22Q8C6A8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bhlhe22Q8C6A8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bhlhe22Q8C6A8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bhlhe22Q8C6A8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bhlhe22Q8C6A8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bhlhe22Q8C6A8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bhlhe22Q8C6A8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bhlhe22Q8C6A8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bhlhe22Q8C6A8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bhlhe22Q8C6A8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bhlhe22Q8C6A8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Bhlhe22Q8C6A8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bhlhe22Q8C6A8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bhlhe22Q8C6A8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bhlhe22Q8C6A8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bhlhe22Q8C6A8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bhlhe22Q8C6A8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Bhlhe22Q8C6A8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Bhlhe22Q8C6A8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bhlhe22Q8C6A8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bhlhe22Q8C6A8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bhlhe22Q8C6A8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bhlhe22Q8C6A8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bhlhe22Q8C6A8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Bhlhe22Q8C6A8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bhlhe22Q8C6A8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bhlhe22Q8C6A8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Bhlhe22Q8C6A8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bhlhe22Q8C6A8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bhlhe22Q8C6A8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bhlhe22Q8C6A8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Bhlhe22Q8C6A8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bhlhe22Q8C6A8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bhlhe22Q8C6A8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bhlhe22Q8C6A8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bhlhe22Q8C6A8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bhlhe22Q8C6A8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bhlhe22Q8C6A8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bhlhe22Q8C6A8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bhlhe22Q8C6A8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bhlhe22Q8C6A8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bhlhe22Q8C6A8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bhlhe22Q8C6A8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bhlhe22Q8C6A8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bhlhe22Q8C6A8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bhlhe22Q8C6A8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bhlhe22Q8C6A8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bhlhe22Q8C6A8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bhlhe22Q8C6A8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bhlhe22Q8C6A8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bhlhe22Q8C6A8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bhlhe22Q8C6A8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bhlhe22Q8C6A8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bhlhe22Q8C6A8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bhlhe22Q8C6A8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bhlhe22Q8C6A8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bhlhe22Q8C6A8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bhlhe22Q8C6A8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bhlhe22Q8C6A8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bhlhe22Q8C6A8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bhlhe22Q8C6A8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bhlhe22Q8C6A8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bhlhe22Q8C6A8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bhlhe22Q8C6A8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bhlhe22Q8C6A8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bhlhe22Q8C6A8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bhlhe22Q8C6A8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bhlhe22Q8C6A8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bhlhe22Q8C6A8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bhlhe22Q8C6A8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bhlhe22Q8C6A8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bhlhe22Q8C6A8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bhlhe22Q8C6A8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Bhlhe22Q8C6A8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Bhlhe22Q8C6A8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bhlhe22Q8C6A8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bhlhe22Q8C6A8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bhlhe22Q8C6A8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bhlhe22Q8C6A8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bhlhe22Q8C6A8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bhlhe22Q8C6A8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bhlhe22Q8C6A8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bhlhe22Q8C6A8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bhlhe22Q8C6A8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bhlhe22Q8C6A8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bhlhe22Q8C6A8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bhlhe22Q8C6A8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bhlhe22Q8C6A8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bhlhe22Q8C6A8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bhlhe22Q8C6A8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bhlhe22Q8C6A8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms