Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc90bQ8C3X2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc90bQ8C3X2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc90bQ8C3X2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc90bQ8C3X2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc90bQ8C3X2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc90bQ8C3X2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc90bQ8C3X2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc90bQ8C3X2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc90bQ8C3X2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc90bQ8C3X2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc90bQ8C3X2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc90bQ8C3X2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc90bQ8C3X2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc90bQ8C3X2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc90bQ8C3X2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc90bQ8C3X2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc90bQ8C3X2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc90bQ8C3X2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc90bQ8C3X2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc90bQ8C3X2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc90bQ8C3X2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc90bQ8C3X2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc90bQ8C3X2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc90bQ8C3X2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc90bQ8C3X2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc90bQ8C3X2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc90bQ8C3X2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc90bQ8C3X2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc90bQ8C3X2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc90bQ8C3X2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc90bQ8C3X2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc90bQ8C3X2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc90bQ8C3X2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc90bQ8C3X2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc90bQ8C3X2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc90bQ8C3X2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc90bQ8C3X2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc90bQ8C3X2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc90bQ8C3X2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc90bQ8C3X2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc90bQ8C3X2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc90bQ8C3X2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc90bQ8C3X2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc90bQ8C3X2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc90bQ8C3X2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc90bQ8C3X2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc90bQ8C3X2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc90bQ8C3X2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc90bQ8C3X2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc90bQ8C3X2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc90bQ8C3X2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc90bQ8C3X2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc90bQ8C3X2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc90bQ8C3X2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc90bQ8C3X2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc90bQ8C3X2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc90bQ8C3X2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc90bQ8C3X2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc90bQ8C3X2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc90bQ8C3X2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc90bQ8C3X2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc90bQ8C3X2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc90bQ8C3X2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc90bQ8C3X2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc90bQ8C3X2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc90bQ8C3X2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc90bQ8C3X2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc90bQ8C3X2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc90bQ8C3X2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc90bQ8C3X2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc90bQ8C3X2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc90bQ8C3X2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc90bQ8C3X2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc90bQ8C3X2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc90bQ8C3X2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc90bQ8C3X2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc90bQ8C3X2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc90bQ8C3X2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc90bQ8C3X2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc90bQ8C3X2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc90bQ8C3X2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc90bQ8C3X2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc90bQ8C3X2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc90bQ8C3X2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc90bQ8C3X2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc90bQ8C3X2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc90bQ8C3X2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc90bQ8C3X2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc90bQ8C3X2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc90bQ8C3X2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc90bQ8C3X2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc90bQ8C3X2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc90bQ8C3X2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc90bQ8C3X2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc90bQ8C3X2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc90bQ8C3X2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms