Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp37Q8C0R0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp37Q8C0R0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp37Q8C0R0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp37Q8C0R0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp37Q8C0R0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp37Q8C0R0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp37Q8C0R0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp37Q8C0R0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp37Q8C0R0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp37Q8C0R0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp37Q8C0R0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp37Q8C0R0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp37Q8C0R0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp37Q8C0R0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp37Q8C0R0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp37Q8C0R0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp37Q8C0R0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp37Q8C0R0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp37Q8C0R0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp37Q8C0R0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp37Q8C0R0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp37Q8C0R0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp37Q8C0R0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp37Q8C0R0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp37Q8C0R0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp37Q8C0R0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp37Q8C0R0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp37Q8C0R0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp37Q8C0R0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp37Q8C0R0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp37Q8C0R0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp37Q8C0R0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp37Q8C0R0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp37Q8C0R0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp37Q8C0R0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp37Q8C0R0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp37Q8C0R0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp37Q8C0R0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp37Q8C0R0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp37Q8C0R0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp37Q8C0R0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp37Q8C0R0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp37Q8C0R0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp37Q8C0R0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp37Q8C0R0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp37Q8C0R0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp37Q8C0R0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp37Q8C0R0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp37Q8C0R0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp37Q8C0R0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp37Q8C0R0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp37Q8C0R0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp37Q8C0R0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp37Q8C0R0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp37Q8C0R0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp37Q8C0R0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp37Q8C0R0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp37Q8C0R0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp37Q8C0R0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp37Q8C0R0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp37Q8C0R0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp37Q8C0R0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp37Q8C0R0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp37Q8C0R0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp37Q8C0R0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp37Q8C0R0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp37Q8C0R0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp37Q8C0R0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp37Q8C0R0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp37Q8C0R0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp37Q8C0R0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp37Q8C0R0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp37Q8C0R0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp37Q8C0R0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp37Q8C0R0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp37Q8C0R0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp37Q8C0R0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp37Q8C0R0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp37Q8C0R0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp37Q8C0R0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp37Q8C0R0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp37Q8C0R0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp37Q8C0R0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Usp37Q8C0R0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp37Q8C0R0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp37Q8C0R0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp37Q8C0R0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp37Q8C0R0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp37Q8C0R0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp37Q8C0R0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp37Q8C0R0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp37Q8C0R0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp37Q8C0R0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp37Q8C0R0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp37Q8C0R0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp37Q8C0R0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp37Q8C0R0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp37Q8C0R0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp37Q8C0R0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms