Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVM7

Als2cr12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2cr12Q8BVM7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Als2cr12Q8BVM7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Als2cr12Q8BVM7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Als2cr12Q8BVM7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Als2cr12Q8BVM7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Als2cr12Q8BVM7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Als2cr12Q8BVM7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Als2cr12Q8BVM7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Als2cr12Q8BVM7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Als2cr12Q8BVM7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Als2cr12Q8BVM7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Als2cr12Q8BVM7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Als2cr12Q8BVM7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Als2cr12Q8BVM7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Als2cr12Q8BVM7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Als2cr12Q8BVM7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Als2cr12Q8BVM7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Als2cr12Q8BVM7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Als2cr12Q8BVM7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Als2cr12Q8BVM7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Als2cr12Q8BVM7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Als2cr12Q8BVM7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Als2cr12Q8BVM7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Als2cr12Q8BVM7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Als2cr12Q8BVM7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Als2cr12Q8BVM7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Als2cr12Q8BVM7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Als2cr12Q8BVM7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Als2cr12Q8BVM7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Als2cr12Q8BVM7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Als2cr12Q8BVM7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Als2cr12Q8BVM7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Als2cr12Q8BVM7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Als2cr12Q8BVM7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Als2cr12Q8BVM7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Als2cr12Q8BVM7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Als2cr12Q8BVM7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Als2cr12Q8BVM7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Als2cr12Q8BVM7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Als2cr12Q8BVM7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Als2cr12Q8BVM7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Als2cr12Q8BVM7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Als2cr12Q8BVM7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Als2cr12Q8BVM7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Als2cr12Q8BVM7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Als2cr12Q8BVM7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Als2cr12Q8BVM7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Als2cr12Q8BVM7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Als2cr12Q8BVM7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Als2cr12Q8BVM7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Als2cr12Q8BVM7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Als2cr12Q8BVM7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Als2cr12Q8BVM7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Als2cr12Q8BVM7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Als2cr12Q8BVM7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Als2cr12Q8BVM7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Als2cr12Q8BVM7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Als2cr12Q8BVM7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Als2cr12Q8BVM7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Als2cr12Q8BVM7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Als2cr12Q8BVM7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Als2cr12Q8BVM7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Als2cr12Q8BVM7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Als2cr12Q8BVM7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Als2cr12Q8BVM7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Als2cr12Q8BVM7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Als2cr12Q8BVM7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Als2cr12Q8BVM7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Als2cr12Q8BVM7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Als2cr12Q8BVM7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Als2cr12Q8BVM7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Als2cr12Q8BVM7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Als2cr12Q8BVM7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Als2cr12Q8BVM7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Als2cr12Q8BVM7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Als2cr12Q8BVM7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Als2cr12Q8BVM7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Als2cr12Q8BVM7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Als2cr12Q8BVM7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Als2cr12Q8BVM7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Als2cr12Q8BVM7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Als2cr12Q8BVM7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Als2cr12Q8BVM7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Als2cr12Q8BVM7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Als2cr12Q8BVM7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Als2cr12Q8BVM7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Als2cr12Q8BVM7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Als2cr12Q8BVM7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Als2cr12Q8BVM7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Als2cr12Q8BVM7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Als2cr12Q8BVM7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Als2cr12Q8BVM7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Als2cr12Q8BVM7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Als2cr12Q8BVM7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Als2cr12Q8BVM7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Als2cr12Q8BVM7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Als2cr12Q8BVM7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Als2cr12Q8BVM7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Als2cr12Q8BVM7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Als2cr12Q8BVM7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms