Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Lmod1Q8BVA4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lmod1Q8BVA4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Lmod1Q8BVA4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Lmod1Q8BVA4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lmod1Q8BVA4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lmod1Q8BVA4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lmod1Q8BVA4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lmod1Q8BVA4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Lmod1Q8BVA4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lmod1Q8BVA4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Lmod1Q8BVA4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lmod1Q8BVA4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lmod1Q8BVA4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lmod1Q8BVA4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lmod1Q8BVA4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lmod1Q8BVA4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lmod1Q8BVA4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lmod1Q8BVA4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lmod1Q8BVA4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lmod1Q8BVA4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lmod1Q8BVA4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Lmod1Q8BVA4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lmod1Q8BVA4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lmod1Q8BVA4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lmod1Q8BVA4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lmod1Q8BVA4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lmod1Q8BVA4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lmod1Q8BVA4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lmod1Q8BVA4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lmod1Q8BVA4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lmod1Q8BVA4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lmod1Q8BVA4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lmod1Q8BVA4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lmod1Q8BVA4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lmod1Q8BVA4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lmod1Q8BVA4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lmod1Q8BVA4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lmod1Q8BVA4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lmod1Q8BVA4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lmod1Q8BVA4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lmod1Q8BVA4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Lmod1Q8BVA4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lmod1Q8BVA4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lmod1Q8BVA4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lmod1Q8BVA4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lmod1Q8BVA4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lmod1Q8BVA4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lmod1Q8BVA4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lmod1Q8BVA4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lmod1Q8BVA4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lmod1Q8BVA4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lmod1Q8BVA4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lmod1Q8BVA4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lmod1Q8BVA4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lmod1Q8BVA4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lmod1Q8BVA4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lmod1Q8BVA4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lmod1Q8BVA4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lmod1Q8BVA4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lmod1Q8BVA4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lmod1Q8BVA4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lmod1Q8BVA4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Lmod1Q8BVA4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lmod1Q8BVA4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lmod1Q8BVA4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lmod1Q8BVA4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lmod1Q8BVA4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lmod1Q8BVA4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lmod1Q8BVA4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lmod1Q8BVA4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lmod1Q8BVA4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lmod1Q8BVA4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lmod1Q8BVA4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lmod1Q8BVA4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lmod1Q8BVA4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lmod1Q8BVA4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lmod1Q8BVA4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lmod1Q8BVA4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lmod1Q8BVA4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lmod1Q8BVA4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lmod1Q8BVA4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lmod1Q8BVA4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lmod1Q8BVA4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lmod1Q8BVA4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lmod1Q8BVA4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lmod1Q8BVA4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lmod1Q8BVA4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lmod1Q8BVA4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lmod1Q8BVA4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lmod1Q8BVA4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lmod1Q8BVA4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lmod1Q8BVA4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lmod1Q8BVA4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lmod1Q8BVA4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lmod1Q8BVA4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lmod1Q8BVA4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Lmod1Q8BVA4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lmod1Q8BVA4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lmod1Q8BVA4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms