Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUJ9

Lrp12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp12Q8BUJ9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrp12Q8BUJ9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrp12Q8BUJ9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrp12Q8BUJ9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrp12Q8BUJ9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrp12Q8BUJ9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrp12Q8BUJ9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrp12Q8BUJ9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrp12Q8BUJ9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrp12Q8BUJ9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrp12Q8BUJ9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrp12Q8BUJ9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrp12Q8BUJ9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrp12Q8BUJ9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrp12Q8BUJ9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrp12Q8BUJ9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrp12Q8BUJ9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp12Q8BUJ9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp12Q8BUJ9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp12Q8BUJ9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrp12Q8BUJ9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrp12Q8BUJ9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrp12Q8BUJ9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrp12Q8BUJ9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrp12Q8BUJ9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrp12Q8BUJ9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrp12Q8BUJ9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrp12Q8BUJ9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrp12Q8BUJ9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrp12Q8BUJ9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrp12Q8BUJ9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrp12Q8BUJ9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lrp12Q8BUJ9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrp12Q8BUJ9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrp12Q8BUJ9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrp12Q8BUJ9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrp12Q8BUJ9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrp12Q8BUJ9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrp12Q8BUJ9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrp12Q8BUJ9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrp12Q8BUJ9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrp12Q8BUJ9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrp12Q8BUJ9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrp12Q8BUJ9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrp12Q8BUJ9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrp12Q8BUJ9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrp12Q8BUJ9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrp12Q8BUJ9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrp12Q8BUJ9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrp12Q8BUJ9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrp12Q8BUJ9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrp12Q8BUJ9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrp12Q8BUJ9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrp12Q8BUJ9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrp12Q8BUJ9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrp12Q8BUJ9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrp12Q8BUJ9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrp12Q8BUJ9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrp12Q8BUJ9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrp12Q8BUJ9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrp12Q8BUJ9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrp12Q8BUJ9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrp12Q8BUJ9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrp12Q8BUJ9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrp12Q8BUJ9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrp12Q8BUJ9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrp12Q8BUJ9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrp12Q8BUJ9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrp12Q8BUJ9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrp12Q8BUJ9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrp12Q8BUJ9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrp12Q8BUJ9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrp12Q8BUJ9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrp12Q8BUJ9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrp12Q8BUJ9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrp12Q8BUJ9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrp12Q8BUJ9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrp12Q8BUJ9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrp12Q8BUJ9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrp12Q8BUJ9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrp12Q8BUJ9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrp12Q8BUJ9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrp12Q8BUJ9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrp12Q8BUJ9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrp12Q8BUJ9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrp12Q8BUJ9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrp12Q8BUJ9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrp12Q8BUJ9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrp12Q8BUJ9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrp12Q8BUJ9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrp12Q8BUJ9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrp12Q8BUJ9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrp12Q8BUJ9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrp12Q8BUJ9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrp12Q8BUJ9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrp12Q8BUJ9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrp12Q8BUJ9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrp12Q8BUJ9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrp12Q8BUJ9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrp12Q8BUJ9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.6 ms