Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTG3

Tcp11l1, T-complex protein 11-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp11l1Q8BTG3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tcp11l1Q8BTG3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tcp11l1Q8BTG3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tcp11l1Q8BTG3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tcp11l1Q8BTG3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tcp11l1Q8BTG3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tcp11l1Q8BTG3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tcp11l1Q8BTG3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tcp11l1Q8BTG3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tcp11l1Q8BTG3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tcp11l1Q8BTG3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tcp11l1Q8BTG3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tcp11l1Q8BTG3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tcp11l1Q8BTG3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tcp11l1Q8BTG3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tcp11l1Q8BTG3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Tcp11l1Q8BTG3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tcp11l1Q8BTG3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tcp11l1Q8BTG3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tcp11l1Q8BTG3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tcp11l1Q8BTG3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tcp11l1Q8BTG3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tcp11l1Q8BTG3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tcp11l1Q8BTG3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Tcp11l1Q8BTG3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tcp11l1Q8BTG3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Tcp11l1Q8BTG3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Tcp11l1Q8BTG3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tcp11l1Q8BTG3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tcp11l1Q8BTG3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tcp11l1Q8BTG3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tcp11l1Q8BTG3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tcp11l1Q8BTG3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tcp11l1Q8BTG3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tcp11l1Q8BTG3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tcp11l1Q8BTG3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tcp11l1Q8BTG3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tcp11l1Q8BTG3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tcp11l1Q8BTG3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tcp11l1Q8BTG3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tcp11l1Q8BTG3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Tcp11l1Q8BTG3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tcp11l1Q8BTG3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tcp11l1Q8BTG3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tcp11l1Q8BTG3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tcp11l1Q8BTG3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tcp11l1Q8BTG3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tcp11l1Q8BTG3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tcp11l1Q8BTG3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tcp11l1Q8BTG3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tcp11l1Q8BTG3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tcp11l1Q8BTG3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tcp11l1Q8BTG3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tcp11l1Q8BTG3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tcp11l1Q8BTG3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tcp11l1Q8BTG3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tcp11l1Q8BTG3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tcp11l1Q8BTG3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Tcp11l1Q8BTG3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tcp11l1Q8BTG3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tcp11l1Q8BTG3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Tcp11l1Q8BTG3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tcp11l1Q8BTG3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tcp11l1Q8BTG3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tcp11l1Q8BTG3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tcp11l1Q8BTG3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tcp11l1Q8BTG3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tcp11l1Q8BTG3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tcp11l1Q8BTG3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tcp11l1Q8BTG3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tcp11l1Q8BTG3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tcp11l1Q8BTG3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tcp11l1Q8BTG3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tcp11l1Q8BTG3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Tcp11l1Q8BTG3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tcp11l1Q8BTG3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tcp11l1Q8BTG3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tcp11l1Q8BTG3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tcp11l1Q8BTG3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tcp11l1Q8BTG3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tcp11l1Q8BTG3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tcp11l1Q8BTG3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tcp11l1Q8BTG3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tcp11l1Q8BTG3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tcp11l1Q8BTG3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tcp11l1Q8BTG3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tcp11l1Q8BTG3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tcp11l1Q8BTG3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tcp11l1Q8BTG3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tcp11l1Q8BTG3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tcp11l1Q8BTG3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tcp11l1Q8BTG3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tcp11l1Q8BTG3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tcp11l1Q8BTG3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tcp11l1Q8BTG3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tcp11l1Q8BTG3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tcp11l1Q8BTG3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tcp11l1Q8BTG3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tcp11l1Q8BTG3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tcp11l1Q8BTG3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms