Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLE7

Slc17a6, Vesicular glutamate transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a6Q8BLE7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc17a6Q8BLE7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc17a6Q8BLE7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc17a6Q8BLE7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc17a6Q8BLE7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc17a6Q8BLE7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc17a6Q8BLE7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc17a6Q8BLE7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc17a6Q8BLE7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc17a6Q8BLE7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc17a6Q8BLE7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc17a6Q8BLE7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc17a6Q8BLE7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc17a6Q8BLE7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc17a6Q8BLE7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc17a6Q8BLE7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc17a6Q8BLE7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc17a6Q8BLE7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slc17a6Q8BLE7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slc17a6Q8BLE7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc17a6Q8BLE7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc17a6Q8BLE7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc17a6Q8BLE7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc17a6Q8BLE7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc17a6Q8BLE7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc17a6Q8BLE7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc17a6Q8BLE7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc17a6Q8BLE7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc17a6Q8BLE7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc17a6Q8BLE7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc17a6Q8BLE7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc17a6Q8BLE7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc17a6Q8BLE7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc17a6Q8BLE7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc17a6Q8BLE7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc17a6Q8BLE7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc17a6Q8BLE7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc17a6Q8BLE7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc17a6Q8BLE7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc17a6Q8BLE7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc17a6Q8BLE7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc17a6Q8BLE7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc17a6Q8BLE7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc17a6Q8BLE7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc17a6Q8BLE7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc17a6Q8BLE7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc17a6Q8BLE7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc17a6Q8BLE7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc17a6Q8BLE7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slc17a6Q8BLE7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc17a6Q8BLE7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc17a6Q8BLE7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc17a6Q8BLE7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc17a6Q8BLE7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc17a6Q8BLE7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc17a6Q8BLE7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc17a6Q8BLE7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc17a6Q8BLE7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc17a6Q8BLE7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc17a6Q8BLE7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc17a6Q8BLE7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc17a6Q8BLE7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc17a6Q8BLE7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc17a6Q8BLE7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc17a6Q8BLE7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc17a6Q8BLE7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc17a6Q8BLE7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc17a6Q8BLE7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc17a6Q8BLE7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc17a6Q8BLE7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc17a6Q8BLE7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc17a6Q8BLE7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc17a6Q8BLE7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc17a6Q8BLE7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc17a6Q8BLE7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc17a6Q8BLE7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc17a6Q8BLE7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc17a6Q8BLE7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc17a6Q8BLE7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc17a6Q8BLE7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc17a6Q8BLE7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc17a6Q8BLE7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc17a6Q8BLE7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc17a6Q8BLE7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc17a6Q8BLE7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc17a6Q8BLE7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc17a6Q8BLE7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc17a6Q8BLE7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc17a6Q8BLE7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc17a6Q8BLE7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc17a6Q8BLE7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc17a6Q8BLE7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc17a6Q8BLE7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc17a6Q8BLE7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc17a6Q8BLE7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc17a6Q8BLE7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc17a6Q8BLE7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc17a6Q8BLE7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc17a6Q8BLE7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc17a6Q8BLE7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms