Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII1

Prox2, Prospero homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox2Q8BII1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prox2Q8BII1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Prox2Q8BII1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prox2Q8BII1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Prox2Q8BII1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prox2Q8BII1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prox2Q8BII1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prox2Q8BII1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prox2Q8BII1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prox2Q8BII1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prox2Q8BII1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prox2Q8BII1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prox2Q8BII1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prox2Q8BII1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prox2Q8BII1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prox2Q8BII1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prox2Q8BII1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prox2Q8BII1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prox2Q8BII1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prox2Q8BII1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Prox2Q8BII1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prox2Q8BII1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prox2Q8BII1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prox2Q8BII1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prox2Q8BII1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prox2Q8BII1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prox2Q8BII1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prox2Q8BII1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prox2Q8BII1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prox2Q8BII1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prox2Q8BII1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prox2Q8BII1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prox2Q8BII1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Prox2Q8BII1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prox2Q8BII1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prox2Q8BII1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prox2Q8BII1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prox2Q8BII1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Prox2Q8BII1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prox2Q8BII1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prox2Q8BII1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prox2Q8BII1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prox2Q8BII1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prox2Q8BII1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prox2Q8BII1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prox2Q8BII1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prox2Q8BII1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prox2Q8BII1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prox2Q8BII1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prox2Q8BII1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prox2Q8BII1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prox2Q8BII1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prox2Q8BII1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prox2Q8BII1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prox2Q8BII1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prox2Q8BII1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prox2Q8BII1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prox2Q8BII1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prox2Q8BII1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prox2Q8BII1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prox2Q8BII1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prox2Q8BII1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prox2Q8BII1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prox2Q8BII1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prox2Q8BII1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prox2Q8BII1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prox2Q8BII1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prox2Q8BII1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prox2Q8BII1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prox2Q8BII1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prox2Q8BII1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Prox2Q8BII1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prox2Q8BII1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prox2Q8BII1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prox2Q8BII1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prox2Q8BII1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prox2Q8BII1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prox2Q8BII1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prox2Q8BII1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prox2Q8BII1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prox2Q8BII1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prox2Q8BII1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prox2Q8BII1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prox2Q8BII1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prox2Q8BII1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prox2Q8BII1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prox2Q8BII1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prox2Q8BII1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prox2Q8BII1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prox2Q8BII1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prox2Q8BII1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prox2Q8BII1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prox2Q8BII1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prox2Q8BII1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prox2Q8BII1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prox2Q8BII1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prox2Q8BII1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prox2Q8BII1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prox2Q8BII1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prox2Q8BII1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms