Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmco3Q8BH01 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmco3Q8BH01 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tmco3Q8BH01 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmco3Q8BH01 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmco3Q8BH01 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmco3Q8BH01 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmco3Q8BH01 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmco3Q8BH01 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmco3Q8BH01 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmco3Q8BH01 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmco3Q8BH01 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmco3Q8BH01 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmco3Q8BH01 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmco3Q8BH01 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmco3Q8BH01 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tmco3Q8BH01 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tmco3Q8BH01 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmco3Q8BH01 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmco3Q8BH01 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Tmco3Q8BH01 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmco3Q8BH01 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmco3Q8BH01 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmco3Q8BH01 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmco3Q8BH01 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmco3Q8BH01 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmco3Q8BH01 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmco3Q8BH01 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmco3Q8BH01 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmco3Q8BH01 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmco3Q8BH01 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmco3Q8BH01 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmco3Q8BH01 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tmco3Q8BH01 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmco3Q8BH01 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmco3Q8BH01 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmco3Q8BH01 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmco3Q8BH01 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmco3Q8BH01 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmco3Q8BH01 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmco3Q8BH01 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmco3Q8BH01 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmco3Q8BH01 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmco3Q8BH01 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmco3Q8BH01 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmco3Q8BH01 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmco3Q8BH01 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tmco3Q8BH01 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tmco3Q8BH01 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmco3Q8BH01 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmco3Q8BH01 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmco3Q8BH01 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmco3Q8BH01 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmco3Q8BH01 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmco3Q8BH01 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmco3Q8BH01 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmco3Q8BH01 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmco3Q8BH01 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmco3Q8BH01 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmco3Q8BH01 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmco3Q8BH01 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmco3Q8BH01 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmco3Q8BH01 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmco3Q8BH01 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmco3Q8BH01 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmco3Q8BH01 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmco3Q8BH01 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmco3Q8BH01 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmco3Q8BH01 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmco3Q8BH01 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmco3Q8BH01 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmco3Q8BH01 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmco3Q8BH01 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmco3Q8BH01 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmco3Q8BH01 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmco3Q8BH01 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmco3Q8BH01 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmco3Q8BH01 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmco3Q8BH01 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmco3Q8BH01 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmco3Q8BH01 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmco3Q8BH01 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmco3Q8BH01 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmco3Q8BH01 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmco3Q8BH01 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmco3Q8BH01 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmco3Q8BH01 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmco3Q8BH01 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmco3Q8BH01 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tmco3Q8BH01 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tmco3Q8BH01 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tmco3Q8BH01 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tmco3Q8BH01 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmco3Q8BH01 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmco3Q8BH01 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmco3Q8BH01 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmco3Q8BH01 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmco3Q8BH01 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmco3Q8BH01 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmco3Q8BH01 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms