Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smndc1Q8BGT7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smndc1Q8BGT7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smndc1Q8BGT7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smndc1Q8BGT7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smndc1Q8BGT7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smndc1Q8BGT7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smndc1Q8BGT7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smndc1Q8BGT7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smndc1Q8BGT7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smndc1Q8BGT7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smndc1Q8BGT7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smndc1Q8BGT7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smndc1Q8BGT7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smndc1Q8BGT7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smndc1Q8BGT7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smndc1Q8BGT7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smndc1Q8BGT7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smndc1Q8BGT7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smndc1Q8BGT7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smndc1Q8BGT7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smndc1Q8BGT7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smndc1Q8BGT7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smndc1Q8BGT7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Smndc1Q8BGT7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smndc1Q8BGT7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smndc1Q8BGT7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smndc1Q8BGT7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Smndc1Q8BGT7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smndc1Q8BGT7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smndc1Q8BGT7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smndc1Q8BGT7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smndc1Q8BGT7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smndc1Q8BGT7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smndc1Q8BGT7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smndc1Q8BGT7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smndc1Q8BGT7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smndc1Q8BGT7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smndc1Q8BGT7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smndc1Q8BGT7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smndc1Q8BGT7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smndc1Q8BGT7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smndc1Q8BGT7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smndc1Q8BGT7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smndc1Q8BGT7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smndc1Q8BGT7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smndc1Q8BGT7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smndc1Q8BGT7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smndc1Q8BGT7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smndc1Q8BGT7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smndc1Q8BGT7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smndc1Q8BGT7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smndc1Q8BGT7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smndc1Q8BGT7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smndc1Q8BGT7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smndc1Q8BGT7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smndc1Q8BGT7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smndc1Q8BGT7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smndc1Q8BGT7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smndc1Q8BGT7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smndc1Q8BGT7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smndc1Q8BGT7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smndc1Q8BGT7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smndc1Q8BGT7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smndc1Q8BGT7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smndc1Q8BGT7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smndc1Q8BGT7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smndc1Q8BGT7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smndc1Q8BGT7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smndc1Q8BGT7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smndc1Q8BGT7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smndc1Q8BGT7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smndc1Q8BGT7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smndc1Q8BGT7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smndc1Q8BGT7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smndc1Q8BGT7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smndc1Q8BGT7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smndc1Q8BGT7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smndc1Q8BGT7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smndc1Q8BGT7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smndc1Q8BGT7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smndc1Q8BGT7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smndc1Q8BGT7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smndc1Q8BGT7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smndc1Q8BGT7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smndc1Q8BGT7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smndc1Q8BGT7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smndc1Q8BGT7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smndc1Q8BGT7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smndc1Q8BGT7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smndc1Q8BGT7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smndc1Q8BGT7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smndc1Q8BGT7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smndc1Q8BGT7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Smndc1Q8BGT7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Smndc1Q8BGT7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smndc1Q8BGT7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smndc1Q8BGT7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smndc1Q8BGT7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smndc1Q8BGT7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms