Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vipas39Q8BGQ1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vipas39Q8BGQ1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vipas39Q8BGQ1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vipas39Q8BGQ1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vipas39Q8BGQ1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vipas39Q8BGQ1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vipas39Q8BGQ1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vipas39Q8BGQ1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vipas39Q8BGQ1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vipas39Q8BGQ1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vipas39Q8BGQ1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Vipas39Q8BGQ1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Vipas39Q8BGQ1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Vipas39Q8BGQ1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vipas39Q8BGQ1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Vipas39Q8BGQ1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vipas39Q8BGQ1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vipas39Q8BGQ1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vipas39Q8BGQ1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vipas39Q8BGQ1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vipas39Q8BGQ1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vipas39Q8BGQ1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vipas39Q8BGQ1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vipas39Q8BGQ1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vipas39Q8BGQ1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vipas39Q8BGQ1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vipas39Q8BGQ1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vipas39Q8BGQ1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vipas39Q8BGQ1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vipas39Q8BGQ1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vipas39Q8BGQ1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vipas39Q8BGQ1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vipas39Q8BGQ1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vipas39Q8BGQ1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Vipas39Q8BGQ1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vipas39Q8BGQ1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vipas39Q8BGQ1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vipas39Q8BGQ1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vipas39Q8BGQ1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vipas39Q8BGQ1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vipas39Q8BGQ1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vipas39Q8BGQ1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vipas39Q8BGQ1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vipas39Q8BGQ1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vipas39Q8BGQ1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vipas39Q8BGQ1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vipas39Q8BGQ1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vipas39Q8BGQ1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vipas39Q8BGQ1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vipas39Q8BGQ1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vipas39Q8BGQ1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vipas39Q8BGQ1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vipas39Q8BGQ1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Vipas39Q8BGQ1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vipas39Q8BGQ1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vipas39Q8BGQ1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vipas39Q8BGQ1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vipas39Q8BGQ1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vipas39Q8BGQ1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vipas39Q8BGQ1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vipas39Q8BGQ1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vipas39Q8BGQ1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vipas39Q8BGQ1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vipas39Q8BGQ1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vipas39Q8BGQ1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Vipas39Q8BGQ1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vipas39Q8BGQ1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vipas39Q8BGQ1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vipas39Q8BGQ1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vipas39Q8BGQ1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vipas39Q8BGQ1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vipas39Q8BGQ1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vipas39Q8BGQ1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vipas39Q8BGQ1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vipas39Q8BGQ1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vipas39Q8BGQ1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vipas39Q8BGQ1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vipas39Q8BGQ1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vipas39Q8BGQ1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vipas39Q8BGQ1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vipas39Q8BGQ1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 220.1 ms