Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGN9

Uncharacterized protein C1orf115 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGN9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q8BGN9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q8BGN9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q8BGN9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Q8BGN9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q8BGN9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q8BGN9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Q8BGN9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q8BGN9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q8BGN9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Q8BGN9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Q8BGN9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Q8BGN9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Q8BGN9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Q8BGN9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Q8BGN9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Q8BGN9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Q8BGN9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Q8BGN9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Q8BGN9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Q8BGN9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Q8BGN9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Q8BGN9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Q8BGN9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Q8BGN9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q8BGN9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q8BGN9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q8BGN9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q8BGN9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Q8BGN9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Q8BGN9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Q8BGN9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Q8BGN9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Q8BGN9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Q8BGN9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Q8BGN9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Q8BGN9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Q8BGN9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Q8BGN9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Q8BGN9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q8BGN9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q8BGN9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q8BGN9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q8BGN9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q8BGN9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q8BGN9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Q8BGN9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Q8BGN9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Q8BGN9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q8BGN9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q8BGN9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q8BGN9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q8BGN9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q8BGN9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Q8BGN9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Q8BGN9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q8BGN9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q8BGN9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Q8BGN9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Q8BGN9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Q8BGN9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Q8BGN9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Q8BGN9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Q8BGN9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Q8BGN9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q8BGN9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q8BGN9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q8BGN9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Q8BGN9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Q8BGN9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Q8BGN9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Q8BGN9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q8BGN9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q8BGN9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q8BGN9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q8BGN9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q8BGN9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q8BGN9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Q8BGN9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q8BGN9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q8BGN9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q8BGN9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Q8BGN9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q8BGN9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q8BGN9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q8BGN9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q8BGN9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Q8BGN9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q8BGN9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q8BGN9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q8BGN9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Q8BGN9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Q8BGN9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Q8BGN9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q8BGN9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Q8BGN9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q8BGN9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q8BGN9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Q8BGN9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q8BGN9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms