Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrtm2Q8BGA3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrtm2Q8BGA3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrtm2Q8BGA3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrtm2Q8BGA3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrtm2Q8BGA3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrtm2Q8BGA3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrtm2Q8BGA3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrtm2Q8BGA3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrtm2Q8BGA3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrtm2Q8BGA3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrtm2Q8BGA3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrtm2Q8BGA3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrtm2Q8BGA3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrtm2Q8BGA3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrtm2Q8BGA3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrtm2Q8BGA3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrtm2Q8BGA3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrtm2Q8BGA3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrtm2Q8BGA3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrtm2Q8BGA3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrtm2Q8BGA3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrtm2Q8BGA3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrtm2Q8BGA3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrtm2Q8BGA3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrtm2Q8BGA3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrtm2Q8BGA3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrtm2Q8BGA3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrtm2Q8BGA3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrtm2Q8BGA3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrtm2Q8BGA3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrtm2Q8BGA3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrtm2Q8BGA3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrtm2Q8BGA3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrtm2Q8BGA3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrtm2Q8BGA3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrtm2Q8BGA3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrtm2Q8BGA3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrtm2Q8BGA3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrtm2Q8BGA3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrtm2Q8BGA3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrtm2Q8BGA3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrtm2Q8BGA3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrtm2Q8BGA3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrtm2Q8BGA3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrtm2Q8BGA3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrtm2Q8BGA3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrtm2Q8BGA3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrtm2Q8BGA3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrtm2Q8BGA3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrtm2Q8BGA3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrtm2Q8BGA3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrtm2Q8BGA3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrtm2Q8BGA3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrtm2Q8BGA3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrtm2Q8BGA3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrtm2Q8BGA3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrtm2Q8BGA3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrtm2Q8BGA3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrtm2Q8BGA3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrtm2Q8BGA3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrtm2Q8BGA3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrtm2Q8BGA3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrtm2Q8BGA3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrtm2Q8BGA3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrtm2Q8BGA3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrtm2Q8BGA3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrtm2Q8BGA3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrtm2Q8BGA3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrtm2Q8BGA3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrtm2Q8BGA3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrtm2Q8BGA3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrtm2Q8BGA3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrtm2Q8BGA3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrtm2Q8BGA3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrtm2Q8BGA3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrtm2Q8BGA3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrtm2Q8BGA3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrtm2Q8BGA3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrtm2Q8BGA3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrtm2Q8BGA3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrtm2Q8BGA3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrtm2Q8BGA3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrtm2Q8BGA3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrtm2Q8BGA3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrtm2Q8BGA3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms