Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PPFIBP1Q86W92 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPFIBP1Q86W92 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPFIBP1Q86W92 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPFIBP1Q86W92 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPFIBP1Q86W92 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PPFIBP1Q86W92 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PPFIBP1Q86W92 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPFIBP1Q86W92 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPFIBP1Q86W92 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPFIBP1Q86W92 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPFIBP1Q86W92 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPFIBP1Q86W92 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PPFIBP1Q86W92 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PPFIBP1Q86W92 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PPFIBP1Q86W92 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PPFIBP1Q86W92 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPFIBP1Q86W92 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPFIBP1Q86W92 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPFIBP1Q86W92 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPFIBP1Q86W92 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPFIBP1Q86W92 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPFIBP1Q86W92 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPFIBP1Q86W92 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPFIBP1Q86W92 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPFIBP1Q86W92 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPFIBP1Q86W92 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPFIBP1Q86W92 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPFIBP1Q86W92 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPFIBP1Q86W92 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPFIBP1Q86W92 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPFIBP1Q86W92 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPFIBP1Q86W92 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPFIBP1Q86W92 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPFIBP1Q86W92 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPFIBP1Q86W92 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPFIBP1Q86W92 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPFIBP1Q86W92 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPFIBP1Q86W92 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPFIBP1Q86W92 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPFIBP1Q86W92 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPFIBP1Q86W92 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPFIBP1Q86W92 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPFIBP1Q86W92 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PPFIBP1Q86W92 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPFIBP1Q86W92 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPFIBP1Q86W92 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPFIBP1Q86W92 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPFIBP1Q86W92 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPFIBP1Q86W92 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPFIBP1Q86W92 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPFIBP1Q86W92 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPFIBP1Q86W92 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PPFIBP1Q86W92 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPFIBP1Q86W92 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPFIBP1Q86W92 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PPFIBP1Q86W92 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPFIBP1Q86W92 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPFIBP1Q86W92 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPFIBP1Q86W92 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPFIBP1Q86W92 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPFIBP1Q86W92 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPFIBP1Q86W92 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPFIBP1Q86W92 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPFIBP1Q86W92 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPFIBP1Q86W92 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPFIBP1Q86W92 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPFIBP1Q86W92 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPFIBP1Q86W92 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPFIBP1Q86W92 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPFIBP1Q86W92 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPFIBP1Q86W92 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPFIBP1Q86W92 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPFIBP1Q86W92 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPFIBP1Q86W92 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPFIBP1Q86W92 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPFIBP1Q86W92 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPFIBP1Q86W92 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPFIBP1Q86W92 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPFIBP1Q86W92 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PPFIBP1Q86W92 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PPFIBP1Q86W92 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PPFIBP1Q86W92 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPFIBP1Q86W92 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPFIBP1Q86W92 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPFIBP1Q86W92 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPFIBP1Q86W92 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPFIBP1Q86W92 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPFIBP1Q86W92 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPFIBP1Q86W92 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPFIBP1Q86W92 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPFIBP1Q86W92 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPFIBP1Q86W92 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPFIBP1Q86W92 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPFIBP1Q86W92 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPFIBP1Q86W92 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPFIBP1Q86W92 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPFIBP1Q86W92 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPFIBP1Q86W92 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PPFIBP1Q86W92 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms