Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC84Q86UT8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC84Q86UT8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC84Q86UT8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC84Q86UT8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC84Q86UT8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC84Q86UT8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC84Q86UT8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC84Q86UT8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC84Q86UT8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC84Q86UT8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC84Q86UT8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC84Q86UT8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC84Q86UT8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC84Q86UT8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC84Q86UT8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC84Q86UT8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC84Q86UT8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC84Q86UT8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC84Q86UT8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC84Q86UT8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC84Q86UT8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC84Q86UT8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC84Q86UT8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC84Q86UT8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC84Q86UT8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC84Q86UT8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC84Q86UT8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC84Q86UT8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC84Q86UT8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC84Q86UT8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC84Q86UT8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC84Q86UT8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC84Q86UT8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CCDC84Q86UT8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC84Q86UT8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC84Q86UT8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC84Q86UT8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC84Q86UT8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC84Q86UT8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC84Q86UT8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC84Q86UT8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC84Q86UT8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC84Q86UT8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC84Q86UT8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC84Q86UT8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC84Q86UT8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC84Q86UT8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC84Q86UT8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC84Q86UT8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC84Q86UT8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC84Q86UT8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC84Q86UT8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC84Q86UT8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC84Q86UT8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC84Q86UT8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC84Q86UT8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC84Q86UT8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC84Q86UT8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC84Q86UT8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC84Q86UT8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC84Q86UT8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC84Q86UT8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC84Q86UT8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC84Q86UT8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC84Q86UT8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC84Q86UT8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC84Q86UT8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC84Q86UT8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC84Q86UT8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC84Q86UT8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC84Q86UT8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC84Q86UT8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC84Q86UT8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC84Q86UT8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC84Q86UT8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC84Q86UT8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC84Q86UT8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC84Q86UT8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC84Q86UT8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC84Q86UT8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC84Q86UT8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC84Q86UT8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC84Q86UT8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC84Q86UT8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC84Q86UT8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC84Q86UT8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC84Q86UT8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC84Q86UT8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
CCDC84Q86UT8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC84Q86UT8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC84Q86UT8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC84Q86UT8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC84Q86UT8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC84Q86UT8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC84Q86UT8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC84Q86UT8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC84Q86UT8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC84Q86UT8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC84Q86UT8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms