Protein–RNA interactions for Protein: Q86UF4

CCDC190, Coiled-coil domain-containing protein 190, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC190Q86UF4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC190Q86UF4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC190Q86UF4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC190Q86UF4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC190Q86UF4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC190Q86UF4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC190Q86UF4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC190Q86UF4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC190Q86UF4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC190Q86UF4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC190Q86UF4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC190Q86UF4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC190Q86UF4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC190Q86UF4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC190Q86UF4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC190Q86UF4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC190Q86UF4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC190Q86UF4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC190Q86UF4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC190Q86UF4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC190Q86UF4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC190Q86UF4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC190Q86UF4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC190Q86UF4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC190Q86UF4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC190Q86UF4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC190Q86UF4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC190Q86UF4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC190Q86UF4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC190Q86UF4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC190Q86UF4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC190Q86UF4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC190Q86UF4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC190Q86UF4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC190Q86UF4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC190Q86UF4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC190Q86UF4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC190Q86UF4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC190Q86UF4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC190Q86UF4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC190Q86UF4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC190Q86UF4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC190Q86UF4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC190Q86UF4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC190Q86UF4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC190Q86UF4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC190Q86UF4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC190Q86UF4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC190Q86UF4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC190Q86UF4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC190Q86UF4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC190Q86UF4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC190Q86UF4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC190Q86UF4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC190Q86UF4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC190Q86UF4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC190Q86UF4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC190Q86UF4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC190Q86UF4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC190Q86UF4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC190Q86UF4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC190Q86UF4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC190Q86UF4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC190Q86UF4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC190Q86UF4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC190Q86UF4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC190Q86UF4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC190Q86UF4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC190Q86UF4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC190Q86UF4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC190Q86UF4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC190Q86UF4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC190Q86UF4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC190Q86UF4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC190Q86UF4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC190Q86UF4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC190Q86UF4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC190Q86UF4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC190Q86UF4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC190Q86UF4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC190Q86UF4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC190Q86UF4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC190Q86UF4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC190Q86UF4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC190Q86UF4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC190Q86UF4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC190Q86UF4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC190Q86UF4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC190Q86UF4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC190Q86UF4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC190Q86UF4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC190Q86UF4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC190Q86UF4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC190Q86UF4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC190Q86UF4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC190Q86UF4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC190Q86UF4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC190Q86UF4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC190Q86UF4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC190Q86UF4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms