Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG4DQ86TL0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG4DQ86TL0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG4DQ86TL0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG4DQ86TL0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG4DQ86TL0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG4DQ86TL0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG4DQ86TL0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG4DQ86TL0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG4DQ86TL0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATG4DQ86TL0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATG4DQ86TL0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4DQ86TL0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4DQ86TL0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG4DQ86TL0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG4DQ86TL0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG4DQ86TL0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG4DQ86TL0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG4DQ86TL0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG4DQ86TL0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG4DQ86TL0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG4DQ86TL0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG4DQ86TL0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG4DQ86TL0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG4DQ86TL0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG4DQ86TL0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG4DQ86TL0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG4DQ86TL0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG4DQ86TL0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG4DQ86TL0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG4DQ86TL0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG4DQ86TL0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG4DQ86TL0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG4DQ86TL0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG4DQ86TL0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG4DQ86TL0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG4DQ86TL0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG4DQ86TL0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATG4DQ86TL0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG4DQ86TL0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG4DQ86TL0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG4DQ86TL0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG4DQ86TL0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG4DQ86TL0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG4DQ86TL0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG4DQ86TL0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG4DQ86TL0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG4DQ86TL0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG4DQ86TL0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG4DQ86TL0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG4DQ86TL0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG4DQ86TL0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG4DQ86TL0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG4DQ86TL0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG4DQ86TL0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG4DQ86TL0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG4DQ86TL0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG4DQ86TL0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG4DQ86TL0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG4DQ86TL0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG4DQ86TL0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG4DQ86TL0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG4DQ86TL0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG4DQ86TL0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG4DQ86TL0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG4DQ86TL0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG4DQ86TL0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG4DQ86TL0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG4DQ86TL0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG4DQ86TL0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG4DQ86TL0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG4DQ86TL0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4DQ86TL0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4DQ86TL0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4DQ86TL0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4DQ86TL0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG4DQ86TL0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATG4DQ86TL0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4DQ86TL0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4DQ86TL0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4DQ86TL0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4DQ86TL0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4DQ86TL0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4DQ86TL0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG4DQ86TL0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG4DQ86TL0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG4DQ86TL0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG4DQ86TL0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG4DQ86TL0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG4DQ86TL0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG4DQ86TL0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG4DQ86TL0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG4DQ86TL0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG4DQ86TL0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG4DQ86TL0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG4DQ86TL0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG4DQ86TL0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG4DQ86TL0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG4DQ86TL0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG4DQ86TL0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms