Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC6BQ86SZ2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC6BQ86SZ2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC6BQ86SZ2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC6BQ86SZ2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC6BQ86SZ2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC6BQ86SZ2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC6BQ86SZ2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC6BQ86SZ2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC6BQ86SZ2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC6BQ86SZ2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC6BQ86SZ2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC6BQ86SZ2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC6BQ86SZ2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC6BQ86SZ2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC6BQ86SZ2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC6BQ86SZ2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC6BQ86SZ2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC6BQ86SZ2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC6BQ86SZ2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC6BQ86SZ2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC6BQ86SZ2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC6BQ86SZ2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC6BQ86SZ2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC6BQ86SZ2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC6BQ86SZ2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC6BQ86SZ2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC6BQ86SZ2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC6BQ86SZ2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC6BQ86SZ2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC6BQ86SZ2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC6BQ86SZ2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC6BQ86SZ2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC6BQ86SZ2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC6BQ86SZ2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC6BQ86SZ2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC6BQ86SZ2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC6BQ86SZ2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC6BQ86SZ2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC6BQ86SZ2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC6BQ86SZ2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC6BQ86SZ2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC6BQ86SZ2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC6BQ86SZ2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC6BQ86SZ2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC6BQ86SZ2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC6BQ86SZ2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC6BQ86SZ2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC6BQ86SZ2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC6BQ86SZ2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC6BQ86SZ2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC6BQ86SZ2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC6BQ86SZ2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC6BQ86SZ2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC6BQ86SZ2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC6BQ86SZ2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRAPPC6BQ86SZ2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC6BQ86SZ2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC6BQ86SZ2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC6BQ86SZ2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC6BQ86SZ2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC6BQ86SZ2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC6BQ86SZ2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC6BQ86SZ2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC6BQ86SZ2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC6BQ86SZ2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC6BQ86SZ2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC6BQ86SZ2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms