Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZF2

Ifne, Interferon epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfneQ80ZF2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IfneQ80ZF2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IfneQ80ZF2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IfneQ80ZF2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IfneQ80ZF2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IfneQ80ZF2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IfneQ80ZF2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IfneQ80ZF2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IfneQ80ZF2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IfneQ80ZF2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IfneQ80ZF2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IfneQ80ZF2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IfneQ80ZF2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IfneQ80ZF2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IfneQ80ZF2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IfneQ80ZF2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IfneQ80ZF2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IfneQ80ZF2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IfneQ80ZF2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IfneQ80ZF2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IfneQ80ZF2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IfneQ80ZF2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IfneQ80ZF2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IfneQ80ZF2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IfneQ80ZF2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IfneQ80ZF2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IfneQ80ZF2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IfneQ80ZF2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IfneQ80ZF2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
IfneQ80ZF2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IfneQ80ZF2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IfneQ80ZF2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IfneQ80ZF2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IfneQ80ZF2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IfneQ80ZF2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IfneQ80ZF2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IfneQ80ZF2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IfneQ80ZF2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IfneQ80ZF2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IfneQ80ZF2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IfneQ80ZF2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IfneQ80ZF2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IfneQ80ZF2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IfneQ80ZF2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IfneQ80ZF2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IfneQ80ZF2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IfneQ80ZF2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IfneQ80ZF2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IfneQ80ZF2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IfneQ80ZF2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IfneQ80ZF2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IfneQ80ZF2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IfneQ80ZF2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IfneQ80ZF2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IfneQ80ZF2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IfneQ80ZF2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IfneQ80ZF2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IfneQ80ZF2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IfneQ80ZF2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IfneQ80ZF2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IfneQ80ZF2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IfneQ80ZF2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IfneQ80ZF2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IfneQ80ZF2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IfneQ80ZF2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IfneQ80ZF2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IfneQ80ZF2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IfneQ80ZF2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IfneQ80ZF2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IfneQ80ZF2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IfneQ80ZF2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IfneQ80ZF2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IfneQ80ZF2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IfneQ80ZF2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IfneQ80ZF2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IfneQ80ZF2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IfneQ80ZF2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IfneQ80ZF2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IfneQ80ZF2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IfneQ80ZF2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IfneQ80ZF2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IfneQ80ZF2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IfneQ80ZF2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IfneQ80ZF2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IfneQ80ZF2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IfneQ80ZF2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IfneQ80ZF2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IfneQ80ZF2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IfneQ80ZF2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IfneQ80ZF2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IfneQ80ZF2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IfneQ80ZF2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IfneQ80ZF2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IfneQ80ZF2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IfneQ80ZF2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IfneQ80ZF2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IfneQ80ZF2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IfneQ80ZF2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IfneQ80ZF2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IfneQ80ZF2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms