Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Amigo1Q80ZD8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Amigo1Q80ZD8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Amigo1Q80ZD8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Amigo1Q80ZD8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Amigo1Q80ZD8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Amigo1Q80ZD8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Amigo1Q80ZD8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Amigo1Q80ZD8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Amigo1Q80ZD8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Amigo1Q80ZD8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Amigo1Q80ZD8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Amigo1Q80ZD8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Amigo1Q80ZD8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Amigo1Q80ZD8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Amigo1Q80ZD8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Amigo1Q80ZD8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Amigo1Q80ZD8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Amigo1Q80ZD8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Amigo1Q80ZD8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Amigo1Q80ZD8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Amigo1Q80ZD8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Amigo1Q80ZD8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Amigo1Q80ZD8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Amigo1Q80ZD8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Amigo1Q80ZD8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Amigo1Q80ZD8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Amigo1Q80ZD8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Amigo1Q80ZD8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Amigo1Q80ZD8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Amigo1Q80ZD8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Amigo1Q80ZD8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Amigo1Q80ZD8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Amigo1Q80ZD8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Amigo1Q80ZD8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Amigo1Q80ZD8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Amigo1Q80ZD8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Amigo1Q80ZD8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Amigo1Q80ZD8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Amigo1Q80ZD8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Amigo1Q80ZD8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Amigo1Q80ZD8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Amigo1Q80ZD8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Amigo1Q80ZD8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Amigo1Q80ZD8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Amigo1Q80ZD8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Amigo1Q80ZD8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Amigo1Q80ZD8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Amigo1Q80ZD8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Amigo1Q80ZD8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Amigo1Q80ZD8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Amigo1Q80ZD8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Amigo1Q80ZD8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Amigo1Q80ZD8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Amigo1Q80ZD8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Amigo1Q80ZD8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Amigo1Q80ZD8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Amigo1Q80ZD8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Amigo1Q80ZD8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Amigo1Q80ZD8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Amigo1Q80ZD8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Amigo1Q80ZD8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Amigo1Q80ZD8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Amigo1Q80ZD8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Amigo1Q80ZD8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Amigo1Q80ZD8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Amigo1Q80ZD8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Amigo1Q80ZD8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Amigo1Q80ZD8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Amigo1Q80ZD8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Amigo1Q80ZD8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Amigo1Q80ZD8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Amigo1Q80ZD8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Amigo1Q80ZD8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Amigo1Q80ZD8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Amigo1Q80ZD8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Amigo1Q80ZD8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Amigo1Q80ZD8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Amigo1Q80ZD8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Amigo1Q80ZD8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Amigo1Q80ZD8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Amigo1Q80ZD8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Amigo1Q80ZD8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Amigo1Q80ZD8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Amigo1Q80ZD8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Amigo1Q80ZD8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Amigo1Q80ZD8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Amigo1Q80ZD8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Amigo1Q80ZD8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Amigo1Q80ZD8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Amigo1Q80ZD8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Amigo1Q80ZD8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Amigo1Q80ZD8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Amigo1Q80ZD8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Amigo1Q80ZD8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Amigo1Q80ZD8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Amigo1Q80ZD8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Amigo1Q80ZD8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Amigo1Q80ZD8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Amigo1Q80ZD8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms