Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nrde2Q80XC6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nrde2Q80XC6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nrde2Q80XC6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nrde2Q80XC6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nrde2Q80XC6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nrde2Q80XC6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nrde2Q80XC6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nrde2Q80XC6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nrde2Q80XC6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nrde2Q80XC6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nrde2Q80XC6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nrde2Q80XC6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nrde2Q80XC6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nrde2Q80XC6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nrde2Q80XC6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nrde2Q80XC6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nrde2Q80XC6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nrde2Q80XC6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nrde2Q80XC6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nrde2Q80XC6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nrde2Q80XC6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nrde2Q80XC6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nrde2Q80XC6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nrde2Q80XC6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nrde2Q80XC6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nrde2Q80XC6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nrde2Q80XC6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nrde2Q80XC6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nrde2Q80XC6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nrde2Q80XC6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nrde2Q80XC6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nrde2Q80XC6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nrde2Q80XC6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nrde2Q80XC6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nrde2Q80XC6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nrde2Q80XC6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nrde2Q80XC6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nrde2Q80XC6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nrde2Q80XC6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nrde2Q80XC6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nrde2Q80XC6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nrde2Q80XC6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nrde2Q80XC6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Nrde2Q80XC6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Nrde2Q80XC6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nrde2Q80XC6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nrde2Q80XC6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nrde2Q80XC6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nrde2Q80XC6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nrde2Q80XC6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nrde2Q80XC6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nrde2Q80XC6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nrde2Q80XC6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nrde2Q80XC6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nrde2Q80XC6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nrde2Q80XC6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nrde2Q80XC6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nrde2Q80XC6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nrde2Q80XC6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nrde2Q80XC6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nrde2Q80XC6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nrde2Q80XC6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nrde2Q80XC6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Nrde2Q80XC6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nrde2Q80XC6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nrde2Q80XC6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nrde2Q80XC6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nrde2Q80XC6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nrde2Q80XC6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nrde2Q80XC6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nrde2Q80XC6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nrde2Q80XC6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nrde2Q80XC6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nrde2Q80XC6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nrde2Q80XC6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrde2Q80XC6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrde2Q80XC6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrde2Q80XC6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrde2Q80XC6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrde2Q80XC6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrde2Q80XC6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrde2Q80XC6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrde2Q80XC6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrde2Q80XC6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrde2Q80XC6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrde2Q80XC6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrde2Q80XC6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrde2Q80XC6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrde2Q80XC6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrde2Q80XC6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrde2Q80XC6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrde2Q80XC6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrde2Q80XC6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrde2Q80XC6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nrde2Q80XC6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nrde2Q80XC6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nrde2Q80XC6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nrde2Q80XC6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nrde2Q80XC6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms