Protein–RNA interactions for Protein: Q80TZ3

Dnajc6, Putative tyrosine-protein phosphatase auxilin, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc6Q80TZ3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnajc6Q80TZ3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnajc6Q80TZ3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnajc6Q80TZ3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnajc6Q80TZ3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnajc6Q80TZ3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnajc6Q80TZ3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnajc6Q80TZ3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnajc6Q80TZ3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnajc6Q80TZ3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnajc6Q80TZ3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnajc6Q80TZ3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnajc6Q80TZ3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnajc6Q80TZ3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnajc6Q80TZ3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnajc6Q80TZ3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnajc6Q80TZ3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnajc6Q80TZ3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnajc6Q80TZ3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnajc6Q80TZ3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnajc6Q80TZ3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnajc6Q80TZ3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnajc6Q80TZ3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnajc6Q80TZ3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnajc6Q80TZ3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnajc6Q80TZ3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnajc6Q80TZ3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnajc6Q80TZ3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnajc6Q80TZ3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnajc6Q80TZ3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnajc6Q80TZ3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnajc6Q80TZ3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnajc6Q80TZ3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnajc6Q80TZ3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnajc6Q80TZ3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnajc6Q80TZ3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnajc6Q80TZ3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dnajc6Q80TZ3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dnajc6Q80TZ3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dnajc6Q80TZ3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnajc6Q80TZ3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnajc6Q80TZ3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnajc6Q80TZ3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnajc6Q80TZ3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnajc6Q80TZ3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnajc6Q80TZ3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnajc6Q80TZ3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnajc6Q80TZ3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnajc6Q80TZ3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnajc6Q80TZ3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnajc6Q80TZ3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnajc6Q80TZ3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dnajc6Q80TZ3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dnajc6Q80TZ3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dnajc6Q80TZ3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dnajc6Q80TZ3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dnajc6Q80TZ3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dnajc6Q80TZ3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnajc6Q80TZ3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnajc6Q80TZ3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dnajc6Q80TZ3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnajc6Q80TZ3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnajc6Q80TZ3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnajc6Q80TZ3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnajc6Q80TZ3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Dnajc6Q80TZ3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dnajc6Q80TZ3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnajc6Q80TZ3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnajc6Q80TZ3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnajc6Q80TZ3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnajc6Q80TZ3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnajc6Q80TZ3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnajc6Q80TZ3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dnajc6Q80TZ3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnajc6Q80TZ3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnajc6Q80TZ3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dnajc6Q80TZ3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dnajc6Q80TZ3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnajc6Q80TZ3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnajc6Q80TZ3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnajc6Q80TZ3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnajc6Q80TZ3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnajc6Q80TZ3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnajc6Q80TZ3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnajc6Q80TZ3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dnajc6Q80TZ3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dnajc6Q80TZ3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dnajc6Q80TZ3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dnajc6Q80TZ3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dnajc6Q80TZ3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dnajc6Q80TZ3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Dnajc6Q80TZ3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dnajc6Q80TZ3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dnajc6Q80TZ3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Dnajc6Q80TZ3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Dnajc6Q80TZ3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Dnajc6Q80TZ3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dnajc6Q80TZ3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dnajc6Q80TZ3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dnajc6Q80TZ3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms