Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RD3Q7Z3Z2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RD3Q7Z3Z2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RD3Q7Z3Z2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RD3Q7Z3Z2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RD3Q7Z3Z2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RD3Q7Z3Z2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RD3Q7Z3Z2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RD3Q7Z3Z2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RD3Q7Z3Z2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RD3Q7Z3Z2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RD3Q7Z3Z2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RD3Q7Z3Z2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RD3Q7Z3Z2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RD3Q7Z3Z2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RD3Q7Z3Z2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RD3Q7Z3Z2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RD3Q7Z3Z2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RD3Q7Z3Z2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RD3Q7Z3Z2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RD3Q7Z3Z2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RD3Q7Z3Z2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RD3Q7Z3Z2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RD3Q7Z3Z2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RD3Q7Z3Z2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RD3Q7Z3Z2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RD3Q7Z3Z2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RD3Q7Z3Z2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RD3Q7Z3Z2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RD3Q7Z3Z2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RD3Q7Z3Z2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RD3Q7Z3Z2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RD3Q7Z3Z2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RD3Q7Z3Z2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RD3Q7Z3Z2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RD3Q7Z3Z2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RD3Q7Z3Z2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RD3Q7Z3Z2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RD3Q7Z3Z2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RD3Q7Z3Z2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RD3Q7Z3Z2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RD3Q7Z3Z2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RD3Q7Z3Z2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RD3Q7Z3Z2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RD3Q7Z3Z2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RD3Q7Z3Z2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RD3Q7Z3Z2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RD3Q7Z3Z2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RD3Q7Z3Z2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RD3Q7Z3Z2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RD3Q7Z3Z2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RD3Q7Z3Z2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RD3Q7Z3Z2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RD3Q7Z3Z2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RD3Q7Z3Z2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RD3Q7Z3Z2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RD3Q7Z3Z2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RD3Q7Z3Z2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RD3Q7Z3Z2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RD3Q7Z3Z2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RD3Q7Z3Z2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RD3Q7Z3Z2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RD3Q7Z3Z2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RD3Q7Z3Z2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RD3Q7Z3Z2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RD3Q7Z3Z2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RD3Q7Z3Z2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RD3Q7Z3Z2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RD3Q7Z3Z2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RD3Q7Z3Z2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RD3Q7Z3Z2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RD3Q7Z3Z2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RD3Q7Z3Z2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RD3Q7Z3Z2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RD3Q7Z3Z2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RD3Q7Z3Z2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RD3Q7Z3Z2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RD3Q7Z3Z2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RD3Q7Z3Z2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RD3Q7Z3Z2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RD3Q7Z3Z2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RD3Q7Z3Z2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RD3Q7Z3Z2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RD3Q7Z3Z2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RD3Q7Z3Z2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RD3Q7Z3Z2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RD3Q7Z3Z2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RD3Q7Z3Z2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RD3Q7Z3Z2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RD3Q7Z3Z2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RD3Q7Z3Z2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RD3Q7Z3Z2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RD3Q7Z3Z2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RD3Q7Z3Z2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RD3Q7Z3Z2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RD3Q7Z3Z2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RD3Q7Z3Z2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RD3Q7Z3Z2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RD3Q7Z3Z2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RD3Q7Z3Z2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.9 ms